{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006208096542564381],
[410.2599804317931, 1102.611626994353, 1, 0, 0.2711796416946246, 0.002437478788322258, 0, -0.03924164057851321, 1, 0.2711796416946246, 0.0005979029254055513],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.496535722648955e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209489339328488],
[483.2016563899612, 1288.100364350697, 0, 1, 0.2727946170286158, 0, 0.0007763370213035209, 0.01249846296252511, 0.7272053829713842, 1, 0.0006209627387212306],
[482.6908168639363, 1288.575048596453, 1, 0, 0.2725117817016559, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725117817016558, 0.0006208377730787784],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006209319123432909],
[482.7016563899611, 1288.600364350697, 0, 1, 0.2725123387981699, 0, 0.0007760357886472292, 0.01249361333524411, 0.7274876612018302, 1, 0.0006208170090716917],
[482.9381794259016, 1288.363841314757, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258142, 1, 0.2726458694062598, 0.000620743076369429],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006158810614346545],
[482.9381794259015, 1288.363841314756, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258143, 1, 0.2726458694062598, 0.0006146775698094147],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670786, 0.01249272906197194, 0.7275391549860497, 1, 0.0006158901104089578],
[482.8398138991626, 1288.462206841495, 0, 1, 0.2725903365126103, 0, 0.0007761190003790452, 0.01249495298377253, 0.7274096634873897, 1, 0.0006210468886754342],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006158810614346545],
[482.6908168639363, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725252483672471, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725252483672471, 0.0006158810614346545],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670787, 0.01249272906197195, 0.7275391549860497, 1, 0.0006158810614346545],
[483.0185509439204, 1288.283469796738, 0, 1, 0.272691243666029, 0, 0.0007762266794883098, 0.01249668653933159, 0.7273087563339711, 1, 0.0006189282581394874],
[482.7891823906753, 1288.512838349983, 0, 1, 0.2725617521673691, 0, 0.0007760885031464329, 0.01249446200044724, 0.7274382478326309, 1, 0.0006190817491910662],
[482.9246324023173, 1288.286177294297, 0, 1, 0.2726522612432769, 0, 0.0007762250481490333, 0.01249666027595246, 0.7273477387567231, 1, 0.0005926659116334525],
[409.8512481198265, 1103.02035930632, 0, 0, 0.2709094718335734, 0, 0, 0, 1, 1, 3.289067854201084e-05],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670786, 0.01249272906197194, 0.7275391549860497, 1, 0.0005878211187125281],
[483.2016563899611, 1288.100364350697, 0, 1, 0.2727946170286158, 0, 0.0007763370213035209, 0.01249846296252511, 0.7272053829713843, 1, 0.0006208770745520617],
[410.0126178698278, 1102.858989556318, 1, 0, 0.271016136370874, 0.002438949330865431, 0, -0.03926531524686769, 1, 0.2710161363708741, 0.0006210595197453698],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006210757955573715],
[410.0119911558642, 1102.859616270282, 0, 0, 0.271015722116313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001078864911843562],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0005128747756614358],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 0, 0.2711792274400636, 0, 0, 0, 1, 1, 8.388541478720686e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.000536916335018242],
[482.7341266269001, 1288.567894113758, 0, 1, 0.2725306700802205, 0, 0.0007760553437409465, 0.01249392815806957, 0.7274693299197795, 1, 0.0006210652540364626],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006210382941627062],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209583904799465],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006210652540364626],
[482.7341266269001, 1288.512838349983, 0, 1, 0.2725391411655575, 0, 0.0007760885031464329, 0.01249446200044724, 0.7274608588344424, 1, 0.000620959703941595],
[482.8398138991626, 1288.462206841496, 0, 1, 0.2725903365126103, 0, 0.0007761190003790451, 0.01249495298377253, 0.7274096634873897, 1, 0.0006209099891733793],
[482.8144981449189, 1288.40715107772, 0, 1, 0.2725884128374438, 0, 0.0007761521652247313, 0.01249548691373348, 0.7274115871625562, 1, 0.0006210841511105076],
[482.5800558925744, 1288.721964848084, 0, 1, 0.2724436884517225, 0, 0.0007759625639017344, 0.01249243446995186, 0.7275563115482775, 1, 0.0006210652543406412],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006209686532924233],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006209994242347556],
[482.9381794259016, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2726268332195632, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258142, 1, 0.2726268332195632, 0.0006207382828995774],
[482.6908168639363, 1288.575048596453, 1, 0, 0.2725117817016559, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725117817016558, 0.000620958711155074],
[483.0185509439204, 1288.283469796738, 0, 1, 0.272691243666029, 0, 0.0007762266794883098, 0.01249668653933159, 0.727308756333971, 1, 0.0006209702592993154],
[482.4252591162809, 1288.672708825376, 1, 0, 0.2723876758082153, 0.002072859953128959, 0, -0.03337154179145461, 1, 0.2723876758082153, 0.000620957337461011],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209259722883318],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209099189098991],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209274896241985],
[482.5806826065379, 1288.812549178164, 0, 1, 0.2724300138147935, 0, 0.0007759080252886034, 0.01249155643783753, 0.7275699861852065, 1, 0.0006209113073976387],
[410.0249114654849, 1102.846695960661, 0, 1, 0.2710242623715186, 0, 0.0009067443404986818, 0.0145979262165977, 0.7289757376284813, 1, 0.0006210104082117349],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 1, 0, 0.2711792274400636, 0.002437482511825399, 0, -0.03924170052421312, 1, 0.2711792274400636, 0.0006117786715962568],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.000620995826079686],
[482.4252591162809, 1288.672708825376, 1, 0, 0.2723876758082153, 0.002072859953128959, 0, -0.03337154179145461, 1, 0.2723876758082153, 0.0006209253967961865],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547272638858864e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006210206426065618],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547272638858864e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547272638858864e-05],
[483.2016563899611, 1288.100364350697, 0, 1, 0.2727946170286158, 0, 0.0007763370213035209, 0.01249846296252511, 0.7272053829713843, 1, 0.0006210774689951488],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547273474573234e-05],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006211993791625921],
[482.6908168639363, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725252483672471, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725252483672471, 0.0006209096360616613],
[482.8144981449189, 1288.40715107772, 0, 1, 0.2725884128374438, 0, 0.0007761521652247313, 0.01249548691373348, 0.7274115871625562, 1, 0.0006212135034142296],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006208616466967995],
[410.321485380447, 1102.736386734078, 0, 1, 0.2711869076144561, 0, 0.0009068350441955152, 0.01459938648032895, 0.7288130923855439, 1, 0.0005996123731243074],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.553446730599844e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006208295008873205],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006208242737688663],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006211259610725017],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006208370210087703],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006211243186444853],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006208380445663311],
[410.6674593158323, 1102.204148110314, 0, 0, 0.2714489830465537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000109712596820878],
[483.0185509439204, 1288.283469796738, 0, 1, 0.272691243666029, 0, 0.0007762266794883098, 0.01249668653933159, 0.7273087563339711, 1, 0.000510978850838945],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 1, 0, 0.2711792274400636, 0.002437482511825399, 0, -0.03924170052421312, 1, 0.2711792274400636, 0.0005999695625972174],
[410.2593537178295, 1102.38243233305, 1, 0, 0.2712204287235192, 0.002437482511825399, 0, -0.03924170052421312, 1, 0.2712204287235191, 0.0005975356404892936],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.518441588432967e-05],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 1, 0.2711792274400636, 0, 0.0009069371364564379, 0.01460103009168186, 0.7288207725599364, 1, 0.0005976212285927761],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.505781722499954e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.000620949322527405],
[409.8701146891913, 1102.797439937953, 1, 0, 0.2709584888202482, 0.002439797302026546, 0, -0.03927896696752466, 1, 0.2709584888202482, 0.0006209611993011234],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209082820276593],
[483.2016563899612, 1288.100364350697, 0, 1, 0.2727946170286158, 0, 0.0007763370213035209, 0.01249846296252511, 0.7272053829713842, 1, 0.0006209692973073362],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209346056276755],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006208460011548187],
[482.9381794259015, 1288.363841314756, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258143, 1, 0.2726458694062598, 0.0006210002387246873],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 0, 0.2711792274400636, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002499227753844255],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0003709765044448987],
[482.6908168639363, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725252483672471, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725252483672471, 0.0006208376743334962],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.000620943867161682],
[482.8766298075365, 1288.6116556215, 0, 1, 0.2725824572362829, 0, 0.0007760289887473491, 0.01249350386178804, 0.7274175427637171, 1, 0.0006209248135884709],
[482.9381794259015, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2726268332195632, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258143, 1, 0.2726268332195632, 0.0006146775696662764],
[482.8144981449189, 1288.283469796738, 0, 1, 0.2726074485343342, 0, 0.0007762266794883099, 0.01249668653933159, 0.7273925514656658, 1, 0.0006158720085181734],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547273540834112e-05],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.000621034328363312],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 0, 0.2711792274400636, 0, 0, 0, 1, 1, 3.922721300099938e-06],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006168402833318749],
[410.5067162797947, 1102.364891146351, 0, 1, 0.2713427327638142, 0, 0.0009071406464696986, 0.0146043064552887, 0.7286572672361858, 1, 0.0006207963972905108],
[482.9381794259016, 1288.363841314757, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258142, 1, 0.2726458694062598, 0.0006207930093815997],
[482.3948696629378, 1288.907151077721, 1, 0, 0.2723391403693129, 0.002072990537189433, 0, -0.03337364410011508, 1, 0.2723391403693129, 0.000620720185632796],
[483.0489403972635, 1288.253080343395, 0, 1, 0.2727084002282568, 0, 0.0007762449904124752, 0.01249698133192966, 0.7272915997717432, 1, 0.000620839735008024],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006209572608748365],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006208036987972373],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006208321464207942],
[482.8766298075365, 1288.845019415103, 0, 1, 0.2725465538107543, 0, 0.0007758884776183678, 0.01249124173452474, 0.7274534461892457, 1, 0.0004603074034647248],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.000621117635450643],
[410.2587270038658, 1102.725722177238, 1, 0, 0.2711585880647462, 0.002437486235339918, 0, -0.03924176047009618, 1, 0.2711585880647462, 0.0003142606951235149],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003064846037682351],
[410.5067162797947, 1102.612253708317, 0, 0, 0.2712983740353345, 0, 0, 0, 1, 1, 4.376368595440251e-06],
[482.9381794259015, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2726268332195632, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258143, 1, 0.2726268332195632, 0.0006162732666876844],
[410.5067162797947, 1102.364891146351, 0, 0, 0.2713427327638142, 0, 0, 0, 1, 1, 4.312350981251944e-06],
[482.9381794259016, 1288.363841314757, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258142, 1, 0.2726458694062598, 0.0006163372514569216],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670786, 0.01249272906197194, 0.7275391549860497, 1, 0.0006209342829836866],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006208094227373068],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.000620939099712089],
[482.6104453459175, 1288.600364350697, 0, 1, 0.2724748757764088, 0, 0.0007760357886472292, 0.01249361333524411, 0.7275251242235912, 1, 0.0006209249258580912],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 1, 0.2711792274400636, 0, 0.0009069371364564379, 0.01460103009168186, 0.7288207725599364, 1, 0.0005918223740874268],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006209325746099557],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006211262392902714],
[482.406392546916, 1288.895628193742, 0, 1, 0.2723456456879109, 0, 0.0007758580121816376, 0.01249075126309009, 0.727654354312089, 1, 0.000620928853470235],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670786, 0.01249272906197194, 0.7275391549860497, 1, 0.0006208787977300692],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209921621042398]
],
"NAMES": [
["Node1197"],
["Node1189"],
["Node1188"],
["Node1182"],
["Node422"],
["Node438"],
["Node434"],
["Node462"],
["Node1170"],
["Node1164"],
["Node1161"],
["Node1158"],
["Node1153"],
["Node1145"],
["Node1142"],
["Node720"],
["Node717"],
["Node714"],
["Node711"],
["Node505"],
["Node504"],
["Node484"],
["Node493"],
["Node491"],
["Node683"],
["Node682"],
["Node678"],
["Node677"],
["Node669"],
["Node666"],
["Node661"],
["Node658"],
["Node651"],
["Node646"],
["Node643"],
["Node640"],
["Node636"],
["Node633"],
["Node630"],
["Node627"],
["Node624"],
["Node621"],
["Node618"],
["Node615"],
["Node612"],
["Node609"],
["Node579"],
["Node576"],
["Node535"],
["Node582"],
["Node246"],
["Node241"],
["Node236"],
["Node226"],
["Node673"],
["Node221"],
["Node690"],
["Node695"],
["Node701"],
["Node707"],
["Node1039"],
["Node1038"],
["Node1035"],
["Node1026"],
["Node1019"],
["Node1022"],
["Node1046"],
["Node1049"],
["Node1098"],
["Node1097"],
["Node1084"],
["Node1087"],
["Node1083"],
["Node1079"],
["Node1078"],
["Node1073"],
["Node1070"],
["Node1066"],
["Node1060"],
["Node1063"],
["Node1091"],
["Node1094"],
["Node1129"],
["Node1128"],
["Node1125"],
["Node1115"],
["Node1122"],
["Node1007"],
["Node1001"],
["Node174"],
["Node179"],
["Node794"],
["Node793"],
["Node805"],
["Node804"],
["Node147"],
["Node818"],
["Node823"],
["Node841"],
["Node846"],
["Node860"],
["Node863"],
["Node871"],
["Node870"],
["Node883"],
["Node882"],
["Node891"],
["Node890"],
["Node131"],
["Node936"],
["Node930"],
["Node925"],
["Node918"],
["Node906"],
["Node921"],
["Node110"],
["Node109"],
["Node1"]
],
"RESOLVED": [
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006208096542564381],
[410.2599804317931, 1102.611626994353, 1, 0, 0.2711796416946246, 0.002437478788322258, 0, -0.03924164057851321, 1, 0.2711796416946246, 0.0005979029254055513],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.496535722648955e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209489339328488],
[483.2016563899612, 1288.100364350697, 0, 1, 0.2727946170286158, 0, 0.0007763370213035209, 0.01249846296252511, 0.7272053829713842, 1, 0.0006209627387212306],
[482.6908168639363, 1288.575048596453, 1, 0, 0.2725117817016559, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725117817016558, 0.0006208377730787784],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006209319123432909],
[482.7016563899611, 1288.600364350697, 0, 1, 0.2725123387981699, 0, 0.0007760357886472292, 0.01249361333524411, 0.7274876612018302, 1, 0.0006208170090716917],
[482.9381794259016, 1288.363841314757, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258142, 1, 0.2726458694062598, 0.000620743076369429],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006158810614346545],
[482.9381794259015, 1288.363841314756, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258143, 1, 0.2726458694062598, 0.0006146775698094147],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670786, 0.01249272906197194, 0.7275391549860497, 1, 0.0006158901104089578],
[482.8398138991626, 1288.462206841495, 0, 1, 0.2725903365126103, 0, 0.0007761190003790452, 0.01249495298377253, 0.7274096634873897, 1, 0.0006210468886754342],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006158810614346545],
[482.6908168639363, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725252483672471, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725252483672471, 0.0006158810614346545],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670787, 0.01249272906197195, 0.7275391549860497, 1, 0.0006158810614346545],
[483.0185509439204, 1288.283469796738, 0, 1, 0.272691243666029, 0, 0.0007762266794883098, 0.01249668653933159, 0.7273087563339711, 1, 0.0006189282581394874],
[482.7891823906753, 1288.512838349983, 0, 1, 0.2725617521673691, 0, 0.0007760885031464329, 0.01249446200044724, 0.7274382478326309, 1, 0.0006190817491910662],
[482.9246324023173, 1288.286177294297, 0, 1, 0.2726522612432769, 0, 0.0007762250481490333, 0.01249666027595246, 0.7273477387567231, 1, 0.0005926659116334525],
[409.8512481198265, 1103.02035930632, 0, 0, 0.2709094718335734, 0, 0, 0, 1, 1, 3.289067854201084e-05],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670786, 0.01249272906197194, 0.7275391549860497, 1, 0.0005878211187125281],
[483.2016563899611, 1288.100364350697, 0, 1, 0.2727946170286158, 0, 0.0007763370213035209, 0.01249846296252511, 0.7272053829713843, 1, 0.0006208770745520617],
[410.0126178698278, 1102.858989556318, 1, 0, 0.271016136370874, 0.002438949330865431, 0, -0.03926531524686769, 1, 0.2710161363708741, 0.0006210595197453698],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006210757955573715],
[410.0119911558642, 1102.859616270282, 0, 0, 0.271015722116313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001078864911843562],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0005128747756614358],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 0, 0.2711792274400636, 0, 0, 0, 1, 1, 8.388541478720686e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.000536916335018242],
[482.7341266269001, 1288.567894113758, 0, 1, 0.2725306700802205, 0, 0.0007760553437409465, 0.01249392815806957, 0.7274693299197795, 1, 0.0006210652540364626],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006210382941627062],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209583904799465],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006210652540364626],
[482.7341266269001, 1288.512838349983, 0, 1, 0.2725391411655575, 0, 0.0007760885031464329, 0.01249446200044724, 0.7274608588344424, 1, 0.000620959703941595],
[482.8398138991626, 1288.462206841496, 0, 1, 0.2725903365126103, 0, 0.0007761190003790451, 0.01249495298377253, 0.7274096634873897, 1, 0.0006209099891733793],
[482.8144981449189, 1288.40715107772, 0, 1, 0.2725884128374438, 0, 0.0007761521652247313, 0.01249548691373348, 0.7274115871625562, 1, 0.0006210841511105076],
[482.5800558925744, 1288.721964848084, 0, 1, 0.2724436884517225, 0, 0.0007759625639017344, 0.01249243446995186, 0.7275563115482775, 1, 0.0006210652543406412],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006209686532924233],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006209994242347556],
[482.9381794259016, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2726268332195632, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258142, 1, 0.2726268332195632, 0.0006207382828995774],
[482.6908168639363, 1288.575048596453, 1, 0, 0.2725117817016559, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725117817016558, 0.000620958711155074],
[483.0185509439204, 1288.283469796738, 0, 1, 0.272691243666029, 0, 0.0007762266794883098, 0.01249668653933159, 0.727308756333971, 1, 0.0006209702592993154],
[482.4252591162809, 1288.672708825376, 1, 0, 0.2723876758082153, 0.002072859953128959, 0, -0.03337154179145461, 1, 0.2723876758082153, 0.000620957337461011],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209259722883318],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209099189098991],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209274896241985],
[482.5806826065379, 1288.812549178164, 0, 1, 0.2724300138147935, 0, 0.0007759080252886034, 0.01249155643783753, 0.7275699861852065, 1, 0.0006209113073976387],
[410.0249114654849, 1102.846695960661, 0, 1, 0.2710242623715186, 0, 0.0009067443404986818, 0.0145979262165977, 0.7289757376284813, 1, 0.0006210104082117349],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 1, 0, 0.2711792274400636, 0.002437482511825399, 0, -0.03924170052421312, 1, 0.2711792274400636, 0.0006117786715962568],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.000620995826079686],
[482.4252591162809, 1288.672708825376, 1, 0, 0.2723876758082153, 0.002072859953128959, 0, -0.03337154179145461, 1, 0.2723876758082153, 0.0006209253967961865],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547272638858864e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006210206426065618],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547272638858864e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547272638858864e-05],
[483.2016563899611, 1288.100364350697, 0, 1, 0.2727946170286158, 0, 0.0007763370213035209, 0.01249846296252511, 0.7272053829713843, 1, 0.0006210774689951488],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547273474573234e-05],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006211993791625921],
[482.6908168639363, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725252483672471, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725252483672471, 0.0006209096360616613],
[482.8144981449189, 1288.40715107772, 0, 1, 0.2725884128374438, 0, 0.0007761521652247313, 0.01249548691373348, 0.7274115871625562, 1, 0.0006212135034142296],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006208616466967995],
[410.321485380447, 1102.736386734078, 0, 1, 0.2711869076144561, 0, 0.0009068350441955152, 0.01459938648032895, 0.7288130923855439, 1, 0.0005996123731243074],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.553446730599844e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006208295008873205],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006208242737688663],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006211259610725017],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006208370210087703],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006211243186444853],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006208380445663311],
[410.6674593158323, 1102.204148110314, 0, 0, 0.2714489830465537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000109712596820878],
[483.0185509439204, 1288.283469796738, 0, 1, 0.272691243666029, 0, 0.0007762266794883098, 0.01249668653933159, 0.7273087563339711, 1, 0.000510978850838945],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 1, 0, 0.2711792274400636, 0.002437482511825399, 0, -0.03924170052421312, 1, 0.2711792274400636, 0.0005999695625972174],
[410.2593537178295, 1102.38243233305, 1, 0, 0.2712204287235192, 0.002437482511825399, 0, -0.03924170052421312, 1, 0.2712204287235191, 0.0005975356404892936],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.518441588432967e-05],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 1, 0.2711792274400636, 0, 0.0009069371364564379, 0.01460103009168186, 0.7288207725599364, 1, 0.0005976212285927761],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.505781722499954e-05],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.000620949322527405],
[409.8701146891913, 1102.797439937953, 1, 0, 0.2709584888202482, 0.002439797302026546, 0, -0.03927896696752466, 1, 0.2709584888202482, 0.0006209611993011234],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209082820276593],
[483.2016563899612, 1288.100364350697, 0, 1, 0.2727946170286158, 0, 0.0007763370213035209, 0.01249846296252511, 0.7272053829713842, 1, 0.0006209692973073362],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209346056276755],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006208460011548187],
[482.9381794259015, 1288.363841314756, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258143, 1, 0.2726458694062598, 0.0006210002387246873],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 0, 0.2711792274400636, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002499227753844255],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0003709765044448987],
[482.6908168639363, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725252483672471, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725252483672471, 0.0006208376743334962],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.000620943867161682],
[482.8766298075365, 1288.6116556215, 0, 1, 0.2725824572362829, 0, 0.0007760289887473491, 0.01249350386178804, 0.7274175427637171, 1, 0.0006209248135884709],
[482.9381794259015, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2726268332195632, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258143, 1, 0.2726268332195632, 0.0006146775696662764],
[482.8144981449189, 1288.283469796738, 0, 1, 0.2726074485343342, 0, 0.0007762266794883099, 0.01249668653933159, 0.7273925514656658, 1, 0.0006158720085181734],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 4.547273540834112e-05],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.000621034328363312],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 0, 0.2711792274400636, 0, 0, 0, 1, 1, 3.922721300099938e-06],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006168402833318749],
[410.5067162797947, 1102.364891146351, 0, 1, 0.2713427327638142, 0, 0.0009071406464696986, 0.0146043064552887, 0.7286572672361858, 1, 0.0006207963972905108],
[482.9381794259016, 1288.363841314757, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258142, 1, 0.2726458694062598, 0.0006207930093815997],
[482.3948696629378, 1288.907151077721, 1, 0, 0.2723391403693129, 0.002072990537189433, 0, -0.03337364410011508, 1, 0.2723391403693129, 0.000620720185632796],
[483.0489403972635, 1288.253080343395, 0, 1, 0.2727084002282568, 0, 0.0007762449904124752, 0.01249698133192966, 0.7272915997717432, 1, 0.000620839735008024],
[482.6908168639363, 1288.611203876722, 1, 0, 0.2725062192737195, 0.002071719546058582, 0, -0.03335318206476351, 1, 0.2725062192737195, 0.0006209572608748365],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006208036987972373],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006208321464207942],
[482.8766298075365, 1288.845019415103, 0, 1, 0.2725465538107543, 0, 0.0007758884776183678, 0.01249124173452474, 0.7274534461892457, 1, 0.0004603074034647248],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.000621117635450643],
[410.2587270038658, 1102.725722177238, 1, 0, 0.2711585880647462, 0.002437486235339918, 0, -0.03924176047009618, 1, 0.2711585880647462, 0.0003142606951235149],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 0, 0.2725760443399897, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003064846037682351],
[410.5067162797947, 1102.612253708317, 0, 0, 0.2712983740353345, 0, 0, 0, 1, 1, 4.376368595440251e-06],
[482.9381794259015, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2726268332195632, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258143, 1, 0.2726268332195632, 0.0006162732666876844],
[410.5067162797947, 1102.364891146351, 0, 0, 0.2713427327638142, 0, 0, 0, 1, 1, 4.312350981251944e-06],
[482.9381794259016, 1288.363841314757, 1, 0, 0.2726458694062598, 0.00207065840432985, 0, -0.03333609845258142, 1, 0.2726458694062598, 0.0006163372514569216],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670786, 0.01249272906197194, 0.7275391549860497, 1, 0.0006209342829836866],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006208094227373068],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.000620939099712089],
[482.6104453459175, 1288.600364350697, 0, 1, 0.2724748757764088, 0, 0.0007760357886472292, 0.01249361333524411, 0.7275251242235912, 1, 0.0006209249258580912],
[410.2593537178295, 1102.612253708317, 0, 1, 0.2711792274400636, 0, 0.0009069371364564379, 0.01460103009168186, 0.7288207725599364, 1, 0.0005918223740874268],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 1, 0, 0.2725760443399897, 0.002071188839279316, 0, -0.03334463807054116, 1, 0.2725760443399896, 0.0006209325746099557],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006211262392902714],
[482.406392546916, 1288.895628193742, 0, 1, 0.2723456456879109, 0, 0.0007758580121816376, 0.01249075126309009, 0.727654354312089, 1, 0.000620928853470235],
[482.6104453459175, 1288.691575394741, 0, 1, 0.2724608450139503, 0, 0.0007759808623670786, 0.01249272906197194, 0.7275391549860497, 1, 0.0006208787977300692],
[482.8144981449189, 1288.487522595739, 0, 1, 0.2725760443399897, 0, 0.0007761037514631395, 0.01249470748728655, 0.7274239556600104, 1, 0.0006209921621042398]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9493684915126449, 2.050631508487355, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9988721801094532, 2.001127819890547, 0, 1, 0.3329573933698177, 0, 0.4997182039349669, 8.045100635666966, 0.6670426066301822, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4680915106135624, 1.69576123068678, 0, 1, 0.2163231821090876, 0, 0.589705662509457, 9.493833450439309, 0.7836768178909124, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.159939233506779, 0, 1, 0.2798272966171935, 0, 0.462975987697786, 7.453577603530186, 0.7201727033828065, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5939343526773305, 2.406065647322669, 0, 1, 0.1979781175591102, 0, 0.4156162576498037, 6.691120299966309, 0.8020218824408898, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380205042716298, 2.16197949572837, 1, 0, 0.2793401680905432, 1.193288224933298, 0, -19.21107492452713, 1, 0.2793401680905432, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8403078090227218, 2.158821901592772, 0, 1, 0.2801838833607068, 0, 0.463215608134327, 7.457435318760799, 0.7198161166392931, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 16.09927469585229, 0.4444444444444445, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.003870481099442217, 2.996129518900559, 0, 1, 0.001290160366480738, 0, 0.3337639423435051, 5.373357391358694, 0.9987098396335192, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9493684915126449, 2.050631508487355, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.003870440219991863, 2.996129559780009, 0, 1, 0.001290146739997287, 0, 0.3337639377896011, 5.373357318044142, 0.9987098532600027, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.838020577429433, 2.161979422570567, 1, 0, 0.2793401924764777, 1.193288120761219, 0, -19.21107324743222, 1, 0.2793401924764778, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9493684915126449, 2.050631508487355, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9997476837724946, 2.000252316227506, 0, 1, 0.3332492279241648, 0, 0.4999369289000546, 8.048621948962753, 0.6667507720758352, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.07272617270563, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.997789143554501, 2, 0, 0.3335791652158339, 2, 0, -32.19854939170457, 0.9999999999999999, 0.1112750594660927, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5931388130628306, 2.406861186937169, 1, 0, 0.1977129376876103, 1.685945984273451, 0, -27.14250752318734, 1, 0.1977129376876102, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 1.693111959275737, 0, 0, 0.2164214202996796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 16.09927469585229, 0.4444444444444445, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.593130402979138, 2, 1, 0, 0.2287314214116326, 1.685969889550869, 0, -27.14289238081519, 1, 0.2287314214116326, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 1, 0.1972981339990278, 0, 0.4152641814500649, 6.685452128512843, 0.8027018660009722, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5334587619018138, 2.466541238098186, 0, 1, 0.1778195873006046, 0, 0.4054260210832902, 6.52706488226629, 0.8221804126993953, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380206217854954, 2, 1, 0, 0.2952834857338944, 1.193288057601005, 0, -19.21107223059858, 1, 0.2952834857338944, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9938807204645973, 2.006119279535403, 0, 1, 0.3312935734881991, 0, 0.4984748465363386, 8.025083483361326, 0.6687064265118009, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 16.09927469585229, 0.4444444444444445, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.997960198244734, 2.00112801593978, 0, 1, 0.3327545330359983, 0, 0.4997181549778938, 8.045099847493598, 0.6672454669640017, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380203119222648, 2.161979688077735, 1, 0, 0.2793401039740883, 1.193288498826697, 0, -19.21107933401221, 1, 0.2793401039740884, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9979601675056214, 2.002039832494379, 0, 1, 0.3326533891685405, 0, 0.4994905614610481, 8.041435756946903, 0.6673466108314595, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9991963892924348, 2.000803610707565, 0, 1, 0.3330654630974783, 0, 0.4997991780144576, 8.04640425961593, 0.6669345369025217, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5931304125237941, 2.406869587476205, 1, 0, 0.1977101375079314, 1.685969862420238, 0, -27.1428919440317, 1, 0.1977101375079313, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.07272617270563, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.059525478758992, 1.758052433153742, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[10.6073663480233, 6.694239500196409, 0, 0, 0.6130856546541181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.704151629489516, 9.757289820113463, 0, 0, 0.217001511456419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[6.117726178529931, 8.830252269323621, 0, 0, 0.4092677949645026, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.4751998149569, 11.8264060332628, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.6073663480233, 0, 0, 0.3522048242524832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.6073663480233, 0, 0, 0.3522048242524832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.465639571072103, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2581054966947826, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.063050319917052, 14.23855552830266, 0, 0, 0.1770384984369662, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 8.883551331911734, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2283636252854369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.6073663480233, 0, 0, 0.3522048242524832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.063050319917052, 14.23855552830266, 0, 0, 0.1770384984369662, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.696922857504376, 9.764518592098606, 0, 0, 0.2164214202996796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.6073663480233, 0, 0, 0.3522048242524832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[6.117726178529931, 8.830252269323621, 0, 0, 0.4092677949645026, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.696922857504376, 12.45623084287065, 0, 0, 0.1779776613390802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.89936848247296, 0, 0, 0.346034114995558, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 11.90776013321096, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676371093873343, 2.072720140080205, 1, 0, 0.1840832069919896, 2.138410275673226, 0, -34.42685444049648, 1, 0.1840832069919895, 0.06211459950165541],
[0.9991965258661456, 2.000253081616663, 0, 1, 0.3331266254226852, 0, 0.4999367376011095, 8.048618869188486, 0.6668733745773148, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -8.049637347926144, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.06211459950165541],
[0.9976560892286412, 2.002343910771359, 0, 1, 0.3325520297428804, 0, 0.4994147082429871, 8.040214575152774, 0.6674479702571197, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.050631508487355, 0, 0, 0.2904115407785721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.839256963962354, 0, 0, 0.3522048242524833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[6.110497406544789, 10.13904341964323, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.696922857504376, 11.95383042381393, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.704151629489516, 12.44900207088551, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[6.110497406544789, 10.13904341964323, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[6.110497406544789, 10.13904341964323, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.4751998149569, 11.8264060332628, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5942938538308555, 2.405706146169144, 0, 1, 0.1980979512769518, 0, 0.4156783660350221, 6.692120199920856, 0.8019020487230482, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380207650741713, 2, 1, 0, 0.2952835213142881, 1.19328785356708, 0, -19.21106894580038, 1, 0.2952835213142881, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.61874980156189, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2388116608011657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 17.30160584821972, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 17.30160584821972, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.009454040206465281],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -32.19854939170457, 1, 0.1111111111111109, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[2.704151629489516, 12.44900207088551, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.4751998149569, 11.8264060332628, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9976558822201425, 2.002344117779858, 0, 1, 0.3325519607400475, 0, 0.4994146566119572, 8.040213743930641, 0.6674480392599524, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.835063555789043, 1.164936444210957, 1, 0, 0.611687851929681, 0.5449402538921976, 0, -8.773142840237977, 1, 0.611687851929681, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.61874980156189, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2388116608011657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5956027453457647, 2.404397254654234, 1, 0, 0.1985342484485883, 1.678971441643492, 0, -27.0302224455097, 1, 0.1985342484485884, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9496215528672938, 2.050378447132706, 0, 1, 0.3165405176224313, 0, 0.4877148418129453, 7.851855211590751, 0.6834594823775687, 1, 0.06211459950165541],
[3.61874980156189, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2388116608011657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.696922857504376, 11.95383042381393, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6262171953157221, 2.373782804684277, 0, 0, 0.2087390651052408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.831474723776926, 1.1644455520035, 2, 0, 0.6113229175632297, 1.092016162732258, 0, -17.58066817613715, 1, 0.3737157095380192, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[6.110497406544789, 10.13904341964323, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2283636252854369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.465639571072103, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2581054966947826, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.611521029576747, 13.69008481864296, 0, 0, 0.2087390651052408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.4676310767619091, 2.07272617270563, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.838020524068204, 2.051506504591846, 1, 0, 0.2900199637367006, 1.193288196744228, 0, -19.21107447070355, 1, 0.2900199637367006, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9978528491579984, 2.002147150842002, 0, 1, 0.3326176163859994, 0, 0.499463787953573, 8.04100472289549, 0.6673823836140006, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 8.883551331911734, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.704151629489516, 12.44900207088551, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.4751998149569, 11.8264060332628, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.465639571072103, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2581054966947826, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.465639571072103, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2581054966947826, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.611521029576747, 13.69008481864296, 0, 0, 0.2087390651052408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[4.840164398616728, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.4682308538508252, 2.161037842835755, 0, 1, 0.1780840636184854, 0, 0.4627406240548667, 7.44978841958941, 0.8219159363815146, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.003869906278057688, 2.996130093721943, 0, 1, 0.001289968759352562, 0, 0.3337638783093526, 5.373356360455283, 0.9987100312406474, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380203735008132, 2.161979626499186, 1, 0, 0.2793401245002711, 1.193288411142703, 0, -19.2110779223635, 1, 0.2793401245002711, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380200448551414, 2.161979955144858, 1, 0, 0.2793400149517138, 1.193288879113695, 0, -19.21108545635705, 1, 0.2793400149517138, 0.06211459950165541],
[1, 1.999196364841073, 0, 1, 0.3334226500547888, 0, 0.5002009895508664, 8.052873133916538, 0.6665773499452112, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.838020717340907, 2.161979282659093, 1, 0, 0.2793402391136357, 1.193287921536192, 0, -19.21107004005379, 1, 0.2793402391136357, 0.06211459950165541],
[0.8380207484939803, 2.16197925150602, 1, 0, 0.2793402494979935, 1.19328787717621, 0, -19.21106932589024, 1, 0.2793402494979935, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5939276444951065, 2.406072355504893, 0, 1, 0.1979758814983689, 0, 0.4156150989026093, 6.691101644976923, 0.8020241185016311, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4682521721458975, 2.161080434718218, 0, 1, 0.1780878428706517, 0, 0.4627315040823039, 7.449641594645904, 0.8219121571293483, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 1.693111959275737, 0, 0, 0.2164214202996796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380207643369716, 2.161979235663028, 1, 0, 0.2793402547789905, 1.193287854616805, 0, -19.21106896270019, 1, 0.2793402547789905, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9979767381273558, 2.002023261872644, 0, 1, 0.3326589127091186, 0, 0.4994946957132876, 8.041502315409367, 0.6673410872908814, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8355470096880316, 2.164452990311968, 1, 0, 0.2785156698960106, 1.196820751442065, 0, -19.26794603916215, 1, 0.2785156698960105, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380207648775518, 2.051506334177383, 1, 0, 0.2900200400098825, 1.193287853847053, 0, -19.21106895030775, 1, 0.2900200400098825, 0.06211459950165541],
[1.835365755892139, 1.162594335877172, 1, 0, 0.6122048658789712, 0.5448505273620068, 0, -8.77169830818093, 1, 0.6122048658789712, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.050631508487355, 0, 0, 0.2904115407785721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.837806095908445, 2.162193904091555, 1, 0, 0.2792686986361483, 1.193593607021546, 0, -19.21599135465303, 1, 0.2792686986361483, 0.06211459950165541],
[1.059525478758992, 1.758052433153742, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.059525478758992, 1.758052433153742, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380201943140626, 2.161979805685937, 1, 0, 0.2793400647713542, 1.193288666293443, 0, -19.21108203010536, 1, 0.2793400647713542, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380205269559715, 2.161979473044028, 1, 0, 0.2793401756519905, 1.19328819263223, 0, -19.21107440450336, 1, 0.2793401756519904, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.07272617270563, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.406082395596831, 0, 1, 0.1974312818138285, 0, 0.4156133646254243, 6.691073724372123, 0.8025687181861715, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.839256963962354, 0, 0, 0.3522048242524833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9979767678541599, 2.00202323214584, 0, 1, 0.3326589226180533, 0, 0.4994947031299752, 8.04150243481266, 0.6673410773819467, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.050631508487355, 0, 0, 0.2904115407785721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060775735908824, 1.531689574194187, 1, 0, 0.4091764436634541, 0.9427063291028673, 0, -15.17688814974559, 1, 0.4091764436634541, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 16.09927469585229, 0.4444444444444445, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676373430290407, 2.072719906438498, 1, 0, 0.1840832989639776, 2.138409207277313, 0, -34.4268372400972, 1, 0.1840832989639776, 0.06211459950165541],
[0.8380306345772767, 2, 1, 0, 0.2952859720283114, 1.193273800192787, 0, -19.21084269666724, 1, 0.2952859720283114, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.057188206800535, 1.761301470929907, 0, 1, 0.3750903241383606, 0, 0.5677619740316426, 9.140555981794767, 0.6249096758616395, 1, 0.06211459950165541],
[0.5931389405987545, 2, 1, 0, 0.2287339607270712, 1.68594562176365, 0, -27.14250168704249, 1, 0.2287339607270712, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5931309245800542, 2.406869075419945, 1, 0, 0.1977103081933515, 1.685968406904454, 0, -27.14286851128327, 1, 0.1977103081933514, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.003871155329995948, 2.996128844670005, 0, 1, 0.001290385109998649, 0, 0.3337640174517062, 5.373358600546254, 0.9987096148900013, 1, 0.06211459950165541],
[0.9496216086627779, 2.050378391337222, 0, 1, 0.316540536220926, 0, 0.4877148550847813, 7.851855425257685, 0.683459463779074, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.839256963962354, 0, 0, 0.3522048242524833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.059525478758992, 1.758052433153742, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5931183350150092, 2.40688166498499, 1, 0, 0.1977061116716698, 1.686004193370104, 0, -27.14344464742417, 1, 0.1977061116716697, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5931183350147242, 2, 1, 0, 0.2287278320491133, 1.686004193370915, 0, -27.14344464743721, 1, 0.2287278320491133, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 1.693111959275737, 0, 0, 0.2164214202996796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541]
],
"RESOLVED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9493684915126449, 2.050631508487355, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9988721801094532, 2.001127819890547, 0, 1, 0.3329573933698177, 0, 0.4997182039349669, 8.045100635666966, 0.6670426066301822, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4680915106135624, 1.69576123068678, 0, 1, 0.2163231821090876, 0, 0.589705662509457, 9.493833450439309, 0.7836768178909124, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.159939233506779, 0, 1, 0.2798272966171935, 0, 0.462975987697786, 7.453577603530186, 0.7201727033828065, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5939343526773305, 2.406065647322669, 0, 1, 0.1979781175591102, 0, 0.4156162576498037, 6.691120299966309, 0.8020218824408898, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380205042716298, 2.16197949572837, 1, 0, 0.2793401680905432, 1.193288224933298, 0, -19.21107492452713, 1, 0.2793401680905432, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8403078090227218, 2.158821901592772, 0, 1, 0.2801838833607068, 0, 0.463215608134327, 7.457435318760799, 0.7198161166392931, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 16.09927469585229, 0.4444444444444445, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.003870481099442217, 2.996129518900559, 0, 1, 0.001290160366480738, 0, 0.3337639423435051, 5.373357391358694, 0.9987098396335192, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9493684915126449, 2.050631508487355, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.003870440219991863, 2.996129559780009, 0, 1, 0.001290146739997287, 0, 0.3337639377896011, 5.373357318044142, 0.9987098532600027, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.838020577429433, 2.161979422570567, 1, 0, 0.2793401924764777, 1.193288120761219, 0, -19.21107324743222, 1, 0.2793401924764778, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9493684915126449, 2.050631508487355, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9997476837724946, 2.000252316227506, 0, 1, 0.3332492279241648, 0, 0.4999369289000546, 8.048621948962753, 0.6667507720758352, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.07272617270563, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.997789143554501, 2, 0, 0.3335791652158339, 2, 0, -32.19854939170457, 0.9999999999999999, 0.1112750594660927, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5931388130628306, 2.406861186937169, 1, 0, 0.1977129376876103, 1.685945984273451, 0, -27.14250752318734, 1, 0.1977129376876102, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 1.693111959275737, 0, 0, 0.2164214202996796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 16.09927469585229, 0.4444444444444445, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.593130402979138, 2, 1, 0, 0.2287314214116326, 1.685969889550869, 0, -27.14289238081519, 1, 0.2287314214116326, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 1, 0.1972981339990278, 0, 0.4152641814500649, 6.685452128512843, 0.8027018660009722, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5334587619018138, 2.466541238098186, 0, 1, 0.1778195873006046, 0, 0.4054260210832902, 6.52706488226629, 0.8221804126993953, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380206217854954, 2, 1, 0, 0.2952834857338944, 1.193288057601005, 0, -19.21107223059858, 1, 0.2952834857338944, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9938807204645973, 2.006119279535403, 0, 1, 0.3312935734881991, 0, 0.4984748465363386, 8.025083483361326, 0.6687064265118009, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 16.09927469585229, 0.4444444444444445, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.997960198244734, 2.00112801593978, 0, 1, 0.3327545330359983, 0, 0.4997181549778938, 8.045099847493598, 0.6672454669640017, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380203119222648, 2.161979688077735, 1, 0, 0.2793401039740883, 1.193288498826697, 0, -19.21107933401221, 1, 0.2793401039740884, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9979601675056214, 2.002039832494379, 0, 1, 0.3326533891685405, 0, 0.4994905614610481, 8.041435756946903, 0.6673466108314595, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9991963892924348, 2.000803610707565, 0, 1, 0.3330654630974783, 0, 0.4997991780144576, 8.04640425961593, 0.6669345369025217, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5931304125237941, 2.406869587476205, 1, 0, 0.1977101375079314, 1.685969862420238, 0, -27.1428919440317, 1, 0.1977101375079313, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.07272617270563, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.059525478758992, 1.758052433153742, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[10.6073663480233, 6.694239500196409, 0, 0, 0.6130856546541181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.704151629489516, 9.757289820113463, 0, 0, 0.217001511456419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[6.117726178529931, 8.830252269323621, 0, 0, 0.4092677949645026, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.4751998149569, 11.8264060332628, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.6073663480233, 0, 0, 0.3522048242524832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.6073663480233, 0, 0, 0.3522048242524832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.465639571072103, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2581054966947826, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.063050319917052, 14.23855552830266, 0, 0, 0.1770384984369662, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 8.883551331911734, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2283636252854369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.6073663480233, 0, 0, 0.3522048242524832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.063050319917052, 14.23855552830266, 0, 0, 0.1770384984369662, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.696922857504376, 9.764518592098606, 0, 0, 0.2164214202996796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.6073663480233, 0, 0, 0.3522048242524832, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[6.117726178529931, 8.830252269323621, 0, 0, 0.4092677949645026, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.696922857504376, 12.45623084287065, 0, 0, 0.1779776613390802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 10.89936848247296, 0, 0, 0.346034114995558, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 11.90776013321096, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676371093873343, 2.072720140080205, 1, 0, 0.1840832069919896, 2.138410275673226, 0, -34.42685444049648, 1, 0.1840832069919895, 0.06211459950165541],
[0.9991965258661456, 2.000253081616663, 0, 1, 0.3331266254226852, 0, 0.4999367376011095, 8.048618869188486, 0.6668733745773148, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -8.049637347926144, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.06211459950165541],
[0.9976560892286412, 2.002343910771359, 0, 1, 0.3325520297428804, 0, 0.4994147082429871, 8.040214575152774, 0.6674479702571197, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.050631508487355, 0, 0, 0.2904115407785721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.839256963962354, 0, 0, 0.3522048242524833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[6.110497406544789, 10.13904341964323, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.696922857504376, 11.95383042381393, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.704151629489516, 12.44900207088551, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[6.110497406544789, 10.13904341964323, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[6.110497406544789, 10.13904341964323, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.4751998149569, 11.8264060332628, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5942938538308555, 2.405706146169144, 0, 1, 0.1980979512769518, 0, 0.4156783660350221, 6.692120199920856, 0.8019020487230482, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380207650741713, 2, 1, 0, 0.2952835213142881, 1.19328785356708, 0, -19.21106894580038, 1, 0.2952835213142881, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.61874980156189, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2388116608011657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 17.30160584821972, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 17.30160584821972, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.009454040206465281],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -32.19854939170457, 1, 0.1111111111111109, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[2.704151629489516, 12.44900207088551, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.4751998149569, 11.8264060332628, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9976558822201425, 2.002344117779858, 0, 1, 0.3325519607400475, 0, 0.4994146566119572, 8.040213743930641, 0.6674480392599524, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.835063555789043, 1.164936444210957, 1, 0, 0.611687851929681, 0.5449402538921976, 0, -8.773142840237977, 1, 0.611687851929681, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.61874980156189, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2388116608011657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5956027453457647, 2.404397254654234, 1, 0, 0.1985342484485883, 1.678971441643492, 0, -27.0302224455097, 1, 0.1985342484485884, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9496215528672938, 2.050378447132706, 0, 1, 0.3165405176224313, 0, 0.4877148418129453, 7.851855211590751, 0.6834594823775687, 1, 0.06211459950165541],
[3.61874980156189, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2388116608011657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.696922857504376, 11.95383042381393, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6262171953157221, 2.373782804684277, 0, 0, 0.2087390651052408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.831474723776926, 1.1644455520035, 2, 0, 0.6113229175632297, 1.092016162732258, 0, -17.58066817613715, 1, 0.3737157095380192, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[6.110497406544789, 10.13904341964323, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2283636252854369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.465639571072103, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2581054966947826, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.611521029576747, 13.69008481864296, 0, 0, 0.2087390651052408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.4676310767619091, 2.07272617270563, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.838020524068204, 2.051506504591846, 1, 0, 0.2900199637367006, 1.193288196744228, 0, -19.21107447070355, 1, 0.2900199637367006, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9978528491579984, 2.002147150842002, 0, 1, 0.3326176163859994, 0, 0.499463787953573, 8.04100472289549, 0.6673823836140006, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[3.413574549040416, 13.88803129917929, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 11.53440389881314, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.767201949406569, 8.883551331911734, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[2.704151629489516, 12.44900207088551, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[5.4751998149569, 11.8264060332628, 0, 0, 0.3164561638375484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.413574549040416, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2100720620695352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.465639571072103, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2581054966947826, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.465639571072103, 12.83596627714761, 0, 0, 0.2581054966947826, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[3.611521029576747, 13.69008481864296, 0, 0, 0.2087390651052408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[4.840164398616728, 11.53440389881314, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[4.840164398616728, 12.46144144960298, 0, 0, 0.2797523213207847, 0, 0, 0, 1, 1, 0.009454040206465281],
[0.4682308538508252, 2.161037842835755, 0, 1, 0.1780840636184854, 0, 0.4627406240548667, 7.44978841958941, 0.8219159363815146, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.003869906278057688, 2.996130093721943, 0, 1, 0.001289968759352562, 0, 0.3337638783093526, 5.373356360455283, 0.9987100312406474, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380203735008132, 2.161979626499186, 1, 0, 0.2793401245002711, 1.193288411142703, 0, -19.2110779223635, 1, 0.2793401245002711, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380200448551414, 2.161979955144858, 1, 0, 0.2793400149517138, 1.193288879113695, 0, -19.21108545635705, 1, 0.2793400149517138, 0.06211459950165541],
[1, 1.999196364841073, 0, 1, 0.3334226500547888, 0, 0.5002009895508664, 8.052873133916538, 0.6665773499452112, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.838020717340907, 2.161979282659093, 1, 0, 0.2793402391136357, 1.193287921536192, 0, -19.21107004005379, 1, 0.2793402391136357, 0.06211459950165541],
[0.8380207484939803, 2.16197925150602, 1, 0, 0.2793402494979935, 1.19328787717621, 0, -19.21106932589024, 1, 0.2793402494979935, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5939276444951065, 2.406072355504893, 0, 1, 0.1979758814983689, 0, 0.4156150989026093, 6.691101644976923, 0.8020241185016311, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4682521721458975, 2.161080434718218, 0, 1, 0.1780878428706517, 0, 0.4627315040823039, 7.449641594645904, 0.8219121571293483, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 1.693111959275737, 0, 0, 0.2164214202996796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.071472744778438, 0, 0, 0.1845742384412191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380207643369716, 2.161979235663028, 1, 0, 0.2793402547789905, 1.193287854616805, 0, -19.21106896270019, 1, 0.2793402547789905, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9979767381273558, 2.002023261872644, 0, 1, 0.3326589127091186, 0, 0.4994946957132876, 8.041502315409367, 0.6673410872908814, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8355470096880316, 2.164452990311968, 1, 0, 0.2785156698960106, 1.196820751442065, 0, -19.26794603916215, 1, 0.2785156698960105, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380207648775518, 2.051506334177383, 1, 0, 0.2900200400098825, 1.193287853847053, 0, -19.21106895030775, 1, 0.2900200400098825, 0.06211459950165541],
[1.835365755892139, 1.162594335877172, 1, 0, 0.6122048658789712, 0.5448505273620068, 0, -8.77169830818093, 1, 0.6122048658789712, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.050631508487355, 0, 0, 0.2904115407785721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.7743164900843474, 2.225683509915653, 0, 0, 0.2581054966947824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.837806095908445, 2.162193904091555, 1, 0, 0.2792686986361483, 1.193593607021546, 0, -19.21599135465303, 1, 0.2792686986361483, 0.06211459950165541],
[1.059525478758992, 1.758052433153742, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.059525478758992, 1.758052433153742, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.049637347926144, 0.6666666666666667, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060778906686184, 1.531115495310899, 0, 0, 0.4092677949645027, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380201943140626, 2.161979805685937, 1, 0, 0.2793400647713542, 1.193288666293443, 0, -19.21108203010536, 1, 0.2793400647713542, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8380205269559715, 2.161979473044028, 1, 0, 0.2793401756519905, 1.19328819263223, 0, -19.21107440450336, 1, 0.2793401756519904, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.07272617270563, 0, 0, 0.1840808322766119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.406082395596831, 0, 1, 0.1974312818138285, 0, 0.4156133646254243, 6.691073724372123, 0.8025687181861715, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.540357249467539, 0, 0, 0.3936454214105519, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.839256963962354, 0, 0, 0.3522048242524833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.839256963962354, 1.160743036037646, 0, 0, 0.6130856546541179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 2.159839546481005, 0, 0, 0.1779776613390801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.9979767678541599, 2.00202323214584, 0, 1, 0.3326589226180533, 0, 0.4994947031299752, 8.04150243481266, 0.6673410773819467, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5311154953108991, 2.468884504689101, 0, 0, 0.1770384984369664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.050631508487355, 0, 0, 0.2904115407785721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.060775735908824, 1.531689574194187, 1, 0, 0.4091764436634541, 0.9427063291028673, 0, -15.17688814974559, 1, 0.4091764436634541, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 16.09927469585229, 0.4444444444444445, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.225683509915653, 0, 0, 0.210072062069535, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676373430290407, 2.072719906438498, 1, 0, 0.1840832989639776, 2.138409207277313, 0, -34.4268372400972, 1, 0.1840832989639776, 0.06211459950165541],
[0.8380306345772767, 2, 1, 0, 0.2952859720283114, 1.193273800192787, 0, -19.21084269666724, 1, 0.2952859720283114, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.057188206800535, 1.761301470929907, 0, 1, 0.3750903241383606, 0, 0.5677619740316426, 9.140555981794767, 0.6249096758616395, 1, 0.06211459950165541],
[0.5931389405987545, 2, 1, 0, 0.2287339607270712, 1.68594562176365, 0, -27.14250168704249, 1, 0.2287339607270712, 0.06211459950165541],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.09927469585229, 1, 0.3333333333333333, 0.06211459950165541],
[0.5931309245800542, 2.406869075419945, 1, 0, 0.1977103081933515, 1.685968406904454, 0, -27.14286851128327, 1, 0.1977103081933514, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2, 0, 0, 0.2283636252854368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.003871155329995948, 2.996128844670005, 0, 1, 0.001290385109998649, 0, 0.3337640174517062, 5.373358600546254, 0.9987096148900013, 1, 0.06211459950165541],
[0.9496216086627779, 2.050378391337222, 0, 1, 0.316540536220926, 0, 0.4877148550847813, 7.851855425257685, 0.683459463779074, 1, 0.06211459950165541],
[1, 1.839256963962354, 0, 0, 0.3522048242524833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1.059525478758992, 1.758052433153742, 0, 0, 0.3760412353742953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2, 0, 0, 0.2955903514950335, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 2.158586118553813, 0, 0, 0.1784547087001824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4688845046891009, 1.691858531348545, 0, 0, 0.2170015114564191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5931183350150092, 2.40688166498499, 1, 0, 0.1977061116716698, 1.686004193370104, 0, -27.14344464742417, 1, 0.1977061116716697, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5931183350147242, 2, 1, 0, 0.2287278320491133, 1.686004193370915, 0, -27.14344464743721, 1, 0.2287278320491133, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0, 2.064737846476182, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.8392569639623538, 2.160743036037646, 0, 0, 0.2797523213207846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.5918944019970832, 2.408105598002916, 0, 0, 0.1972981339990278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.6274706232429139, 2, 0, 0, 0.2388116608011656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541],
[0.4676310767619091, 1.693111959275737, 0, 0, 0.2164214202996796, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06211459950165541]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1":{
"Global MG94xREV":0.0006209921621042398,
"Nucleotide GTR":0.0006327674325131618,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "C", "-", "T", "F", "L", "Q", "A", "A", "L", "I", "F", "S", "S", "S", "P", "I", "I", "G", "Y", "S", "I", "V", "Q", "S", "T", "R", "L", "T", "K", "H", "S", "W", "T", "A", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "L", "L", "C", "E", "V", "T", "C", "K", "T", "P", "L", "L", "N", "I", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "N", "R", "M", "M", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "K", "A", "C", "G", "T", "S", "I", "T", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "F", "H", "D", "L", "Y", "H", "R", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "R", "E", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "L", "Y", "N", "L", "Y", "T", "H", "Y", "I", "P", "R", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "F", "S", "T", "N", "S", "G", "K", "I", "C", "I", "I", "R", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "Y", "S", "N", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "TGT", "---", "ACC", "TTT", "CTA", "CAA", "GCC", "GCA", "TTA", "ATC", "TTC", "AGT", "TCA", "TCA", "CCA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAT", "TCA", "ATA", "GTC", "CAG", "TCA", "ACA", "CGC", "TTA", "ACA", "AAG", "CAC", "TCG", "TGG", "ACA", "GCT", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "TTG", "CTT", "TGT", "GAG", "GTT", "ACC", "TGT", "AAA", "ACC", "CCA", "TTG", "TTG", "AAC", "ATC", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "AAT", "AGA", "ATG", "ATG", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "AAA", "GCA", "TGT", "GGC", "ACG", "TCT", "ATC", "ACA", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "TTT", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "CAT", "AGA", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "AGA", "GAG", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "TTG", "TAC", "AAT", "CTT", "TAT", "ACG", "CAC", "TAC", "ATT", "CCA", "AGG", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "TTT", "AGC", "ACT", "AAC", "TCT", "GGA", "AAA", "ATC", "TGT", "ATT", "ATT", "AGG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "TAC", "AGC", "AAC", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1001":{
"Global MG94xREV":0.0006158720085181734,
"Nucleotide GTR":0.0006275501904343734,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "Y", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "TAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1007":{
"Global MG94xREV":0.0006146775696662764,
"Nucleotide GTR":0.0006263331026002074,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAC", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1019":{
"Global MG94xREV":0.0006211259610725017,
"Nucleotide GTR":0.0006329037685811288,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1022":{
"Global MG94xREV":0.0006208370210087703,
"Nucleotide GTR":0.0006326093496279845,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1026":{
"Global MG94xREV":0.0006208242737688663,
"Nucleotide GTR":0.0006325963606745685,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1035":{
"Global MG94xREV":0.0006208295008873205,
"Nucleotide GTR":0.0006326016869097865,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "V", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GTT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1038":{
"Global MG94xREV":4.553446730599844e-05,
"Nucleotide GTR":4.639789312386624e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1039":{
"Global MG94xREV":0.0005996123731243074,
"Nucleotide GTR":0.0006109822393882372,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1046":{
"Global MG94xREV":0.0006211243186444853,
"Nucleotide GTR":0.0006329020950093477,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1049":{
"Global MG94xREV":0.0006208380445663311,
"Nucleotide GTR":0.000632610392594273,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1060":{
"Global MG94xREV":0.0006209692973073362,
"Nucleotide GTR":0.0006327441341533521,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1063":{
"Global MG94xREV":0.0006209346056276755,
"Nucleotide GTR":0.0006327087846491095,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1066":{
"Global MG94xREV":0.0006209082820276593,
"Nucleotide GTR":0.0006326819619002685,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1070":{
"Global MG94xREV":0.0006209611993011234,
"Nucleotide GTR":0.000632735882592523,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1073":{
"Global MG94xREV":0.000620949322527405,
"Nucleotide GTR":0.0006327237806110958,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1078":{
"Global MG94xREV":4.505781722499954e-05,
"Nucleotide GTR":4.591220479095897e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1079":{
"Global MG94xREV":0.0005976212285927761,
"Nucleotide GTR":0.0006089533387194911,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1083":{
"Global MG94xREV":4.518441588432967e-05,
"Nucleotide GTR":4.60412040175394e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1084":{
"Global MG94xREV":0.0005999695625972174,
"Nucleotide GTR":0.0006113462018977288,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGT", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1087":{
"Global MG94xREV":0.0005975356404892936,
"Nucleotide GTR":0.0006088661276920431,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node109":{
"Global MG94xREV":0.0006208787977300692,
"Nucleotide GTR":0.0006326519185206195,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "C", "-", "T", "F", "L", "Q", "A", "A", "L", "I", "F", "S", "S", "S", "P", "I", "I", "G", "Y", "S", "I", "V", "Q", "S", "T", "R", "L", "T", "K", "H", "S", "W", "T", "A", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "L", "L", "C", "E", "V", "T", "C", "K", "T", "P", "L", "L", "N", "I", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "N", "R", "M", "M", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "K", "A", "C", "G", "T", "S", "I", "T", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "F", "H", "D", "L", "Y", "H", "R", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "R", "E", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "L", "Y", "N", "L", "Y", "T", "H", "Y", "I", "P", "R", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "F", "S", "T", "N", "S", "G", "K", "I", "C", "I", "I", "R", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "Y", "S", "N", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "TGT", "---", "ACC", "TTT", "CTA", "CAA", "GCC", "GCA", "TTA", "ATC", "TTC", "AGT", "TCA", "TCA", "CCA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAT", "TCA", "ATA", "GTC", "CAG", "TCA", "ACA", "CGC", "TTA", "ACA", "AAG", "CAC", "TCG", "TGG", "ACA", "GCT", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "TTG", "CTT", "TGT", "GAG", "GTT", "ACC", "TGT", "AAA", "ACC", "CCA", "TTG", "TTG", "AAC", "ATC", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "AAT", "AGA", "ATG", "ATG", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "AAA", "GCA", "TGT", "GGC", "ACG", "TCT", "ATC", "ACA", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "TTT", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "CAT", "AGA", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "AGA", "GAG", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "TTG", "TAC", "AAT", "CTT", "TAT", "ACG", "CAC", "TAC", "ATT", "CCA", "AGG", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "TTT", "AGC", "ACT", "AAC", "TCT", "GGA", "AAA", "ATC", "TGT", "ATT", "ATT", "AGG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "TAC", "AGC", "AAC", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1091":{
"Global MG94xREV":0.0006208460011548187,
"Nucleotide GTR":0.0006326185000558092,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1094":{
"Global MG94xREV":0.0006210002387246873,
"Nucleotide GTR":0.0006327756622827072,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1097":{
"Global MG94xREV":0.000510978850838945,
"Nucleotide GTR":0.0005206680458224701,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1098":{
"Global MG94xREV":0.000109712596820878,
"Nucleotide GTR":0.0001117929700907325,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node110":{
"Global MG94xREV":0.000620928853470235,
"Nucleotide GTR":0.0006327029234191026,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "C", "-", "T", "F", "L", "Q", "A", "A", "L", "I", "F", "S", "S", "S", "P", "I", "I", "G", "Y", "S", "I", "V", "Q", "S", "T", "R", "L", "T", "K", "H", "S", "W", "T", "A", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "L", "L", "C", "E", "V", "T", "C", "K", "T", "P", "L", "L", "N", "I", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "N", "R", "M", "M", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "K", "A", "C", "G", "T", "S", "I", "T", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "F", "H", "D", "L", "Y", "H", "R", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "R", "E", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "L", "Y", "N", "L", "Y", "T", "H", "Y", "I", "P", "R", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "F", "S", "T", "N", "S", "G", "K", "I", "C", "I", "I", "R", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "Y", "S", "N", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "TGT", "---", "ACC", "TTT", "CTA", "CAA", "GCC", "GCA", "TTA", "ATC", "TTC", "AGT", "TCA", "TCA", "CCA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAT", "TCA", "ATA", "GTC", "CAG", "TCA", "ACA", "CGC", "TTA", "ACA", "AAG", "CAC", "TCG", "TGG", "ACA", "GCT", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "TTG", "CTT", "TGT", "GAG", "GTT", "ACC", "TGT", "AAA", "ACC", "CCA", "TTG", "TTG", "AAC", "ATC", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "AAT", "AGA", "ATG", "ATG", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "AAA", "GCA", "TGT", "GGC", "ACG", "TCT", "ATC", "ACA", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "TTT", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "CAT", "AGA", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "AGA", "GAG", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "TTG", "TAC", "AAT", "CTT", "TAT", "ACG", "CAC", "TAC", "ATT", "CCA", "AGG", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "TTT", "AGC", "ACT", "AAC", "TCT", "GGA", "AAA", "ATC", "TGT", "ATT", "ATT", "AGG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "TAC", "AGC", "AAC", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1115":{
"Global MG94xREV":0.000620943867161682,
"Nucleotide GTR":0.0006327182218005777,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1122":{
"Global MG94xREV":0.0006209248135884709,
"Nucleotide GTR":0.0006326988069329897,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1125":{
"Global MG94xREV":0.0006208376743334962,
"Nucleotide GTR":0.0006326100153410725,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1128":{
"Global MG94xREV":0.0003709765044448987,
"Nucleotide GTR":0.000378010971096447,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1129":{
"Global MG94xREV":0.0002499227753844255,
"Nucleotide GTR":0.0002546618179055545,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1142":{
"Global MG94xREV":0.0006158810614346545,
"Nucleotide GTR":0.0006275594150125046,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAT", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1145":{
"Global MG94xREV":0.0006158810614346545,
"Nucleotide GTR":0.0006275594150125046,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1153":{
"Global MG94xREV":0.0006210468886754342,
"Nucleotide GTR":0.0006328231968110994,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "L", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "CTC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1158":{
"Global MG94xREV":0.0006158901104089578,
"Nucleotide GTR":0.0006275686355737072,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "F", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1161":{
"Global MG94xREV":0.0006146775698094147,
"Nucleotide GTR":0.0006263331027460609,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAC", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1164":{
"Global MG94xREV":0.0006158810614346545,
"Nucleotide GTR":0.0006275594150125046,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTT", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1170":{
"Global MG94xREV":0.000620743076369429,
"Nucleotide GTR":0.0006325136236078157,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1182":{
"Global MG94xREV":0.0006209489339328488,
"Nucleotide GTR":0.0006327233846479996,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "S", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "TCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1188":{
"Global MG94xREV":4.496535722648955e-05,
"Nucleotide GTR":4.581799156342154e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1189":{
"Global MG94xREV":0.0005979029254055513,
"Nucleotide GTR":0.0006092403770749562,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1197":{
"Global MG94xREV":0.0006208096542564381,
"Nucleotide GTR":0.0006325814639465447,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "A", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GCA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node131":{
"Global MG94xREV":0.0006209342829836866,
"Nucleotide GTR":0.0006327084558871373,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "F", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "TTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node147":{
"Global MG94xREV":0.000620720185632796,
"Nucleotide GTR":0.000632490298816407,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTT", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node174":{
"Global MG94xREV":4.547273540834112e-05,
"Nucleotide GTR":4.633499066427249e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node179":{
"Global MG94xREV":0.000621034328363312,
"Nucleotide GTR":0.0006328103983299941,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node221":{
"Global MG94xREV":4.547273474573234e-05,
"Nucleotide GTR":4.63349899890993e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node226":{
"Global MG94xREV":4.547272638858864e-05,
"Nucleotide GTR":4.633498147348721e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node236":{
"Global MG94xREV":4.547272638858864e-05,
"Nucleotide GTR":4.633498147348721e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node241":{
"Global MG94xREV":0.0006210206426065618,
"Nucleotide GTR":0.0006327964530635496,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGT", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node246":{
"Global MG94xREV":4.547272638858864e-05,
"Nucleotide GTR":4.633498147348721e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node422":{
"Global MG94xREV":0.0006209627387212306,
"Nucleotide GTR":0.0006327374512031562,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "I", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATT", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node434":{
"Global MG94xREV":0.0006209319123432909,
"Nucleotide GTR":0.000632706040294593,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node438":{
"Global MG94xREV":0.0006208377730787784,
"Nucleotide GTR":0.0006326101159587654,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGT", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node462":{
"Global MG94xREV":0.0006208170090716917,
"Nucleotide GTR":0.0006325889582240059,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "I", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ATT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node484":{
"Global MG94xREV":0.0006208770745520617,
"Nucleotide GTR":0.0006326501626676627,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node491":{
"Global MG94xREV":0.0006210757955573715,
"Nucleotide GTR":0.0006328526518261257,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node493":{
"Global MG94xREV":0.0006210595197453698,
"Nucleotide GTR":0.0006328360673917303,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node504":{
"Global MG94xREV":0.0005878211187125281,
"Nucleotide GTR":0.0005989673988869194,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node505":{
"Global MG94xREV":3.289067854201084e-05,
"Nucleotide GTR":3.351435249057203e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node535":{
"Global MG94xREV":0.000620995826079686,
"Nucleotide GTR":0.0006327711659650106,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node576":{
"Global MG94xREV":0.0006117786715962568,
"Nucleotide GTR":0.0006233792355454805,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node579":{
"Global MG94xREV":0.0006210104082117349,
"Nucleotide GTR":0.0006327860246038474,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node582":{
"Global MG94xREV":0.0006209253967961865,
"Nucleotide GTR":0.0006326994011995059,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node609":{
"Global MG94xREV":0.0006209113073976387,
"Nucleotide GTR":0.0006326850446373969,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "F", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTT", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node612":{
"Global MG94xREV":0.0006209274896241985,
"Nucleotide GTR":0.00063270153371178,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node615":{
"Global MG94xREV":0.0006209099189098991,
"Nucleotide GTR":0.000632683629821114,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node618":{
"Global MG94xREV":0.0006209259722883318,
"Nucleotide GTR":0.0006326999876041489,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node621":{
"Global MG94xREV":0.000620957337461011,
"Nucleotide GTR":0.0006327319475240926,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node624":{
"Global MG94xREV":0.0006209702592993154,
"Nucleotide GTR":0.0006327451143866506,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node627":{
"Global MG94xREV":0.000620958711155074,
"Nucleotide GTR":0.000632733347266181,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node630":{
"Global MG94xREV":0.0006207382828995774,
"Nucleotide GTR":0.000632508739244057,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAC", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node633":{
"Global MG94xREV":0.0006209994242347556,
"Nucleotide GTR":0.0006327748323483959,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node636":{
"Global MG94xREV":0.0006209686532924233,
"Nucleotide GTR":0.0006327434779266106,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node640":{
"Global MG94xREV":0.0006210652543406412,
"Nucleotide GTR":0.0006328419107265537,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.0006210841511105076,
"Nucleotide GTR":0.0006328611658174895,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node646":{
"Global MG94xREV":0.0006209099891733793,
"Nucleotide GTR":0.0006326837014169326,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node651":{
"Global MG94xREV":0.000620959703941595,
"Nucleotide GTR":0.0006327343588779465,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node658":{
"Global MG94xREV":0.0006210652540364626,
"Nucleotide GTR":0.0006328419104166083,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node661":{
"Global MG94xREV":0.0006209583904799465,
"Nucleotide GTR":0.0006327330205104016,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node666":{
"Global MG94xREV":0.0006210382941627062,
"Nucleotide GTR":0.0006328144393289858,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node669":{
"Global MG94xREV":0.0006210652540364626,
"Nucleotide GTR":0.0006328419104166083,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node673":{
"Global MG94xREV":0.0006210774689951488,
"Nucleotide GTR":0.0006328543569956751,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node677":{
"Global MG94xREV":0.000536916335018242,
"Nucleotide GTR":0.0005470973572881262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node678":{
"Global MG94xREV":8.388541478720686e-05,
"Nucleotide GTR":8.547605232301218e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node682":{
"Global MG94xREV":0.0005128747756614358,
"Nucleotide GTR":0.0005225999212234423,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node683":{
"Global MG94xREV":0.0001078864911843562,
"Nucleotide GTR":0.000109932237789049,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node690":{
"Global MG94xREV":0.0006211993791625921,
"Nucleotide GTR":0.0006329785788270581,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node695":{
"Global MG94xREV":0.0006209096360616613,
"Nucleotide GTR":0.0006326833416095011,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node701":{
"Global MG94xREV":0.0006212135034142296,
"Nucleotide GTR":0.0006329929709031413,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node707":{
"Global MG94xREV":0.0006208616466967995,
"Nucleotide GTR":0.0006326344422689858,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node711":{
"Global MG94xREV":0.0005926659116334525,
"Nucleotide GTR":0.0006039040589040822,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "L", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTG", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node714":{
"Global MG94xREV":0.0006190817491910662,
"Nucleotide GTR":0.0006308207942979333,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "I", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "ATC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node717":{
"Global MG94xREV":0.0006189282581394874,
"Nucleotide GTR":0.0006306643927448259,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "G", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GGT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node720":{
"Global MG94xREV":0.0006158810614346545,
"Nucleotide GTR":0.0006275594150125046,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "F", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TTT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node734":{
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "C", "-", "T", "F", "L", "Q", "A", "A", "L", "I", "F", "S", "S", "S", "P", "I", "I", "G", "Y", "S", "I", "V", "Q", "S", "T", "R", "L", "T", "K", "H", "S", "W", "T", "A", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "L", "L", "C", "E", "V", "T", "C", "K", "T", "P", "L", "L", "N", "I", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "N", "R", "M", "M", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "K", "A", "C", "G", "T", "S", "I", "T", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "F", "H", "D", "L", "Y", "H", "R", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "R", "E", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "L", "Y", "N", "L", "Y", "T", "H", "Y", "I", "P", "R", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "F", "S", "T", "N", "S", "G", "K", "I", "C", "I", "I", "R", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "Y", "S", "N", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "TGT", "---", "ACC", "TTT", "CTA", "CAA", "GCC", "GCA", "TTA", "ATC", "TTC", "AGT", "TCA", "TCA", "CCA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAT", "TCA", "ATA", "GTC", "CAG", "TCA", "ACA", "CGC", "TTA", "ACA", "AAG", "CAC", "TCG", "TGG", "ACA", "GCT", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "TTG", "CTT", "TGT", "GAG", "GTT", "ACC", "TGT", "AAA", "ACC", "CCA", "TTG", "TTG", "AAC", "ATC", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "AAT", "AGA", "ATG", "ATG", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "AAA", "GCA", "TGT", "GGC", "ACG", "TCT", "ATC", "ACA", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "TTT", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "CAT", "AGA", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "AGA", "GAG", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "TTG", "TAC", "AAT", "CTT", "TAT", "ACG", "CAC", "TAC", "ATT", "CCA", "AGG", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "TTT", "AGC", "ACT", "AAC", "TCT", "GGA", "AAA", "ATC", "TGT", "ATT", "ATT", "AGG", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "TAC", "AGC", "AAC", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node793":{
"Global MG94xREV":0.0006168402833318749,
"Nucleotide GTR":0.0006285368257016471,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node794":{
"Global MG94xREV":3.922721300099938e-06,
"Nucleotide GTR":3.997104048975534e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node804":{
"Global MG94xREV":0.0006207930093815997,
"Nucleotide GTR":0.0006325645034511332,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAC", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node805":{
"Global MG94xREV":0.0006207963972905108,
"Nucleotide GTR":0.0006325679556016653,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "L", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CTT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAC", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node818":{
"Global MG94xREV":0.000620839735008024,
"Nucleotide GTR":0.0006326121150901673,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "T", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ACA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node823":{
"Global MG94xREV":0.0006209572608748365,
"Nucleotide GTR":0.0006327318694856892,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node841":{
"Global MG94xREV":0.0006208036987972373,
"Nucleotide GTR":0.000632575395559763,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node846":{
"Global MG94xREV":0.0006208321464207942,
"Nucleotide GTR":0.0006326043826079386,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "L", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CTT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node860":{
"Global MG94xREV":0.0004603074034647248,
"Nucleotide GTR":0.0004690357650734435,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "H", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAT", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node863":{
"Global MG94xREV":0.000621117635450643,
"Nucleotide GTR":0.0006328952850886009,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "S", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "TCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node870":{
"Global MG94xREV":0.0003064846037682351,
"Nucleotide GTR":0.0003122961732304217,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node871":{
"Global MG94xREV":0.0003142606951235149,
"Nucleotide GTR":0.0003202197150432443,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node882":{
"Global MG94xREV":0.0006162732666876844,
"Nucleotide GTR":0.0006279590572722983,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node883":{
"Global MG94xREV":4.376368595440251e-06,
"Nucleotide GTR":4.459353416771658e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node890":{
"Global MG94xREV":0.0006163372514569216,
"Nucleotide GTR":0.0006280242553224856,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAC", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node891":{
"Global MG94xREV":4.312350981251944e-06,
"Nucleotide GTR":4.394121898827386e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAC", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node906":{
"Global MG94xREV":0.0006209325746099557,
"Nucleotide GTR":0.0006327067151191771,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node918":{
"Global MG94xREV":0.0005918223740874268,
"Nucleotide GTR":0.0006030445261759741,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node921":{
"Global MG94xREV":0.0006211262392902714,
"Nucleotide GTR":0.0006329040520744721,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "S", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "TCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node925":{
"Global MG94xREV":0.0006209249258580912,
"Nucleotide GTR":0.0006326989213314696,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "C", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "TGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node930":{
"Global MG94xREV":0.000620939099712089,
"Nucleotide GTR":0.0006327133639504757,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node936":{
"Global MG94xREV":0.0006208094227373068,
"Nucleotide GTR":0.0006325812280373419,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924876586,
"Nucleotide GTR":0.0006326716329301616,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCC", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489836138699967,
"Nucleotide GTR":0.0006329155616084658,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "Q", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAA", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490387985995722,
"Nucleotide GTR":0.0006329693800306341,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "Y", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TAT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001298604451735505,
"Nucleotide GTR":0.001266452570314162,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "A", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTA", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GCT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAY", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "AS", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "KCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "VF", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "KTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007140382529,
"Nucleotide GTR":0.000632639666035665,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "F", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TTT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006492468784328435,
"Nucleotide GTR":0.0006331723080579682,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCA", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000649171580191943,
"Nucleotide GTR":0.0006330988741107789,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACC", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487793196526455,
"Nucleotide GTR":0.0006327163254697645,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "E", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAG", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924928353,
"Nucleotide GTR":0.0006326716329352103,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "S", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TCA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489352754903954,
"Nucleotide GTR":0.0006328684200288969,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "T", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "ACT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487596659367355,
"Nucleotide GTR":0.0006326971583561772,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "A", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "GCA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488650036048535,
"Nucleotide GTR":0.0006327998879905644,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488939505521559,
"Nucleotide GTR":0.0006328281182463316,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTG", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007141855755,
"Nucleotide GTR":0.00063263966617934,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "L", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CTC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648891513407077,
"Nucleotide GTR":0.0006328257414420289,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTT", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "LF", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTK", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486646784307976,
"Nucleotide GTR":0.000632604522626428,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487562188639262,
"Nucleotide GTR":0.0006326937966287375,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488789425090634,
"Nucleotide GTR":0.0006328134817843012,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488857193765605,
"Nucleotide GTR":0.0006328200908647258,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "N", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "AAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133894275,
"Nucleotide GTR":0.000632825741424816,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "L", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TTA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133894275,
"Nucleotide GTR":0.000632825741424816,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAT", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAC", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001297994575578484,
"Nucleotide GTR":0.001265857793955897,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "L", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCA", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CTA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486837388719266,
"Nucleotide GTR":0.0006326231111540016,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "I", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417939_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488387025120249,
"Nucleotide GTR":0.000632774238081101,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCC", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "KQE", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-AG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488021367021019,
"Nucleotide GTR":0.0006327385775965698,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "F", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTT", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418309_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487596657270484,
"Nucleotide GTR":0.0006326971581516823,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "G", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GGT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418309_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006485460422455132,
"Nucleotide GTR":0.0006324888237301361,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486924683374813,
"Nucleotide GTR":0.0006326316244885091,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488021368671071,
"Nucleotide GTR":0.0006327385777574907,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCT", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490387985955919,
"Nucleotide GTR":0.0006329693800267532,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "K", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "AAG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007146737458,
"Nucleotide GTR":0.0006326396666554235,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "I", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "ATC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACY", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418737_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006489434260507817,
"Nucleotide GTR":0.0006328763687912287,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648824787226094,
"Nucleotide GTR":0.0006327606673208823,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "I", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "ATT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490328301182337,
"Nucleotide GTR":0.0006329635593217024,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "T", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "ACA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489064654565637,
"Nucleotide GTR":0.0006328403232967862,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAC", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488915134769595,
"Nucleotide GTR":0.0006328257415101812,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "Y", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "TAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488915134769595,
"Nucleotide GTR":0.0006328257415101812,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "S", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "TCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "KR", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "ARG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "EV", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GWG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486095532837058,
"Nucleotide GTR":0.0006325507623115527,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGC", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489352756430707,
"Nucleotide GTR":0.000632868420177791,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAA", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488482772730803,
"Nucleotide GTR":0.0006327835757826105,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGC", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACY", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007142044008,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661977004,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "F", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "TTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGT", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "AV", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GYC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAR", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420191_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133246646,
"Nucleotide GTR":0.0006328257413616557,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAT", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420191_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420287_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420287_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":5.10126719207571e-06,
"Nucleotide GTR":4.974965963368992e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "F", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TTT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "HP", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CMT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAY", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420718_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007142044008,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661977004,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "D", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAT", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420727_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAY", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420730_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006488569517905461,
"Nucleotide GTR":0.0006327920355294761,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924928353,
"Nucleotide GTR":0.0006326716329352103,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATC", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488915134159312,
"Nucleotide GTR":0.0006328257414506635,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "Y", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "TAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924928353,
"Nucleotide GTR":0.0006326716329352103,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "L", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "CTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000626626480583107,
"Nucleotide GTR":0.000611111964001668,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "S", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "TCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAC", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487596657746127,
"Nucleotide GTR":0.0006326971581980689,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "R", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AGA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001297969155161969,
"Nucleotide GTR":0.001265833002918262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "V", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAC", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GTT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488021368688361,
"Nucleotide GTR":0.000632738577759176,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "L", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CTA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487613707472405,
"Nucleotide GTR":0.0006326988209576289,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487596657746127,
"Nucleotide GTR":0.0006326971581980689,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "C", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TGT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "V", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GTT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "TI", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "AYA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421893_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "VL", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "KTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489457691483215,
"Nucleotide GTR":0.0006328786538764978,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "H", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAT", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAY", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006493437611845733,
"Nucleotide GTR":0.0006332667921095079,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "G", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "GG-", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "AV", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GYA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTY", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486976054236407,
"Nucleotide GTR":0.0006326366343866053,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "F", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "TTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001298277465939504,
"Nucleotide GTR":0.001266133680292456,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "F", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "F", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "TTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "TTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924449457,
"Nucleotide GTR":0.0006326716328885064,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAC", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487392199872857,
"Nucleotide GTR":0.0006326772186237991,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAA", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487665349551556,
"Nucleotide GTR":0.0006327038573059791,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTA", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488745369004459,
"Nucleotide GTR":0.0006328091852532448,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "H", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAC", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487465625282232,
"Nucleotide GTR":0.0006326843793722705,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAC", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006484880283944321,
"Nucleotide GTR":0.0006324322462321017,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006493390118493211,
"Nucleotide GTR":0.0006332621603620733,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGA", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488482774856122,
"Nucleotide GTR":0.0006327835759898808,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCC", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030712338,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533540821,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "I", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ATT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423055_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423124_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423124_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423136_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489025389386509,
"Nucleotide GTR":0.0006328364939947258,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAA", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423136_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423153_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "CF", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TKT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423153_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423158_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423158_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423178_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTR", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423178_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488595593889693,
"Nucleotide GTR":0.000632794578566905,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "S", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "TCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "TTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423363_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423387_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "KQ", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "MAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423387_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488614184949352,
"Nucleotide GTR":0.0006327963916436467,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "I", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ATA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "GV", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GKT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423454_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423457_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423457_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423461_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "QH", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAN", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTG", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423461_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423467_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "SG", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "RGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423467_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648919069371485,
"Nucleotide GTR":0.0006328526151539626,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423469_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "AG", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GST", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423492_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423494_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "DG", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GRT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423494_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423530_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "DA", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GMC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423530_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "RG", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "SGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423567_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "GV", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GKG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGK", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423579_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423778_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAY", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423778_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "KR", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "ARA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423783_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423803_England_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423803_England_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423804_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "SRGC", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "NGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423804_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423808_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030763247,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533590471,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAT", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423808_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "SF", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TYT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423825_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488428119342342,
"Nucleotide GTR":0.0006327782457589684,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488571793332307,
"Nucleotide GTR":0.0006327922574384784,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "L", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CTA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006497580256399807,
"Nucleotide GTR":0.0006336707998761823,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "A", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GCT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00064858300786033,
"Nucleotide GTR":0.0006325248741208732,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "L", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CTT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10":{
"Global MG94xREV":9.968809144047244e-06,
"Nucleotide GTR":9.721993441942532e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "I", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATT", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "KR", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "ARA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCK", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006491996028189947,
"Nucleotide GTR":0.0006331262029313507,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006237427256575936,
"Nucleotide GTR":0.0006082996073732184,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGA", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006487091329607762,
"Nucleotide GTR":0.0006326478765158117,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAC", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648858303040862,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533244624,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAT", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486063558121419,
"Nucleotide GTR":0.0006325476440055325,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "R", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CGT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425279_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091330083825,
"Nucleotide GTR":0.0006326478765622386,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ACG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425279_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425425_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648877645597572,
"Nucleotide GTR":0.0006328122169827753,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "T", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "ACT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425425_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425436_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425436_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425491_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487353059770988,
"Nucleotide GTR":0.0006326734015197878,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTG", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425491_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006485798404553193,
"Nucleotide GTR":0.0006325217851369935,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "P", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "CCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006266264994272641,
"Nucleotide GTR":0.0006111119823792668,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGT", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006266339401310455,
"Nucleotide GTR":0.0006111192388601877,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "D", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAT", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "RI", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AKA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486507197250995,
"Nucleotide GTR":0.000632590909521463,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTC", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488021368674393,
"Nucleotide GTR":0.000632738577757816,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "L", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "TTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648697605427933,
"Nucleotide GTR":0.0006326366343907911,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "I", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATT", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489416767541227,
"Nucleotide GTR":0.0006328746628050476,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "G", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "GGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490975403993649,
"Nucleotide GTR":0.0006330266674542469,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACA", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "SL", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TYA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030430955,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533266405,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAT", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487353059770988,
"Nucleotide GTR":0.0006326734015197878,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "C", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TGT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001239486700511649,
"Nucleotide GTR":0.00120879850337439,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "L", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "I", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTA", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ATC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGN", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":5.101271497574673e-06,
"Nucleotide GTR":4.974970162268994e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "V", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GTC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091328399814,
"Nucleotide GTR":0.0006326478763980076,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTC", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488583029543843,
"Nucleotide GTR":0.0006327933532401262,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATT", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001297878005555861,
"Nucleotide GTR":0.001265744110066567,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "Y", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "TAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00064886137295491,
"Nucleotide GTR":0.0006327963472311378,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030689997,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533519035,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCT", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487576629293705,
"Nucleotide GTR":0.0006326952049408612,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "F", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "TTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091328399814,
"Nucleotide GTR":0.0006326478763980076,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTC", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487619307582765,
"Nucleotide GTR":0.0006326993671034664,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489267258572006,
"Nucleotide GTR":0.0006328600820743175,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "R", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AGG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648858637463904,
"Nucleotide GTR":0.0006327936794675929,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "TTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006486837387148242,
"Nucleotide GTR":0.0006326231110007901,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "C", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "TGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030691823,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533520821,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "TTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAY", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006490358947912753,
"Nucleotide GTR":0.000632966548117132,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "S", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091329607762,
"Nucleotide GTR":0.0006326478765158117,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTC", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487091328293346,
"Nucleotide GTR":0.0006326478763876247,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAC", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486140036605883,
"Nucleotide GTR":0.0006325551025024664,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTT", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030596274,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533427639,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "F", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "TTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006267530097752792,
"Nucleotide GTR":0.0006112353604835079,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "Y", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "TAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489728610236325,
"Nucleotide GTR":0.0006329050749896209,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "I", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "ATC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487871026548078,
"Nucleotide GTR":0.0006327239157741716,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "H", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAT", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006485011478839928,
"Nucleotide GTR":0.0006324450408989097,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATC", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007139215226,
"Nucleotide GTR":0.0006326396659218254,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "V", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GTA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648893738590219,
"Nucleotide GTR":0.0006328279115323169,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489025391168506,
"Nucleotide GTR":0.0006328364941685135,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "S", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "AGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489352755565221,
"Nucleotide GTR":0.0006328684200933856,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "I", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "ATC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490063956072009,
"Nucleotide GTR":0.0006329377792973091,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGT", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":2.368245105417643e-06,
"Nucleotide GTR":2.309610210315979e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "I", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "ATC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487353057616506,
"Nucleotide GTR":0.0006326734013096746,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "V", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "GTA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487353058086697,
"Nucleotide GTR":0.000632673401355529,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTG", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489233130763047,
"Nucleotide GTR":0.0006328567537897635,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "I", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "ATA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429037_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429037_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "KE", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "RAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "IV", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "RTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487353059770796,
"Nucleotide GTR":0.0006326734015197697,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "E", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "GAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11":{
"Global MG94xREV":0.000648858637463904,
"Nucleotide GTR":0.0006327936794675929,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "I", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ATC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487876016323288,
"Nucleotide GTR":0.00063272440239761,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATC", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924876586,
"Nucleotide GTR":0.0006326716329301616,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "T", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ACT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489022027985116,
"Nucleotide GTR":0.0006328361661770117,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "Y", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TAC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006492530905020426,
"Nucleotide GTR":0.000633178366323819,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "I", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "ATC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006488584940352811,
"Nucleotide GTR":0.0006327935395900904,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "I", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ATT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490387985955919,
"Nucleotide GTR":0.0006329693800267532,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "N", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488021368691693,
"Nucleotide GTR":0.0006327385777595011,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATT", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487380201003301,
"Nucleotide GTR":0.0006326760484445988,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "L", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CTC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "AV", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GYT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487793192303531,
"Nucleotide GTR":0.0006327163250579272,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "C", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TGT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487007142021808,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661955341,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "F", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TTC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006487527611653514,
"Nucleotide GTR":0.0006326904245386125,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001297732830491122,
"Nucleotide GTR":0.001265602529361498,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "V", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCC", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GTT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487537958669169,
"Nucleotide GTR":0.0006326914336222145,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489022026240892,
"Nucleotide GTR":0.0006328361660069076,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "D", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GAC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091329607762,
"Nucleotide GTR":0.0006326478765158117,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAC", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006498025204951757,
"Nucleotide GTR":0.0006337141930923788,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "A", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "GCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490574452600383,
"Nucleotide GTR":0.0006329875650222566,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "Y", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TAT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648882540859169,
"Nucleotide GTR":0.0006328169910435948,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "S", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "TCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006491265523530495,
"Nucleotide GTR":0.0006330549611069183,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "L", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTA", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTY", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "DG", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GRT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "PL", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CYC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000648858303040862,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533244624,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "I", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ATA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGY", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAY", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "HY", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "YAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133945463,
"Nucleotide GTR":0.0006328257414298082,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "I", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ATT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCW", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "DG", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GRT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006492927741756468,
"Nucleotide GTR":0.0006332170674774832,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATA", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "TP", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "MCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "TI", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "AYT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "RC", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "YGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489397784721097,
"Nucleotide GTR":0.0006328728115222098,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "S", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "TCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489234273321694,
"Nucleotide GTR":0.0006328568652167911,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490324110569542,
"Nucleotide GTR":0.0006329631506358743,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "I", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "ATT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "HL", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CWT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAR", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "NS", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "ART", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030691823,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533520821,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "V", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GTA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091328293532,
"Nucleotide GTR":0.0006326478763876423,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGC", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAR", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "MI", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATK", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTY", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "VF", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "KTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "HY", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "YAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "G", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "GGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432600_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432733_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648756620908307,
"Nucleotide GTR":0.0006326941887189833,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGG", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432733_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006492634411928597,
"Nucleotide GTR":0.0006331884607440036,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "Y", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TAT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490626565141296,
"Nucleotide GTR":0.0006329926472519759,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "A", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "GCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488061491025886,
"Nucleotide GTR":0.0006327424906548561,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCC", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006486801145273762,
"Nucleotide GTR":0.0006326195765438562,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAG", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488198544207876,
"Nucleotide GTR":0.0006327558566458905,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATC", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488915134769595,
"Nucleotide GTR":0.0006328257415101812,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "L", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CTT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334922840221,
"Nucleotide GTR":0.0006326716327315663,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAC", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433677_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "V", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GTT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433677_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433679_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "V", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GTT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433679_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433715_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006239485262685547,
"Nucleotide GTR":0.0006085003126090392,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAA", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433715_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433746_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091327923573,
"Nucleotide GTR":0.000632647876351563,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGC", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433746_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433793_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489025389761083,
"Nucleotide GTR":0.000632836494031256,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACA", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433793_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433858_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489154353461415,
"Nucleotide GTR":0.0006328490711027065,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGT", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433858_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487256588598914,
"Nucleotide GTR":0.0006326639932535782,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGT", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488756394437274,
"Nucleotide GTR":0.0006328102604988827,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "C", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "TGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489044550173955,
"Nucleotide GTR":0.0006328383626336693,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489114067596804,
"Nucleotide GTR":0.0006328451422591928,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "C", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006488626677483729,
"Nucleotide GTR":0.0006327976099670744,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488558735952643,
"Nucleotide GTR":0.0006327909840290113,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "I", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATT", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCT", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACT", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487007141855755,
"Nucleotide GTR":0.00063263966617934,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "V", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GTT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488776447488722,
"Nucleotide GTR":0.0006328122161550888,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "CGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00064907278268745,
"Nucleotide GTR":0.0006330025227134466,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006514683283565535,
"Nucleotide GTR":0.0006353387575583887,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "-", "I", "T", "R", "C", "N", "-", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTT", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "---", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "---", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "KN", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAK", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000623742725640641,
"Nucleotide GTR":0.0006082996073566856,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "T", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "ACT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487121780344355,
"Nucleotide GTR":0.0006326508461971158,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "L", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "CTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "V", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GTC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488674432375912,
"Nucleotide GTR":0.0006328022672209349,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTT", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006489352754941896,
"Nucleotide GTR":0.0006328684200325969,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "D", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GAT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006490387985955919,
"Nucleotide GTR":0.0006329693800267532,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCA", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001680237536534585,
"Nucleotide GTR":0.0001638636879797152,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "H", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAT", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006487596657369182,
"Nucleotide GTR":0.0006326971581613073,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "V", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "GTC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924928353,
"Nucleotide GTR":0.0006326716329352103,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCC", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488943426922652,
"Nucleotide GTR":0.0006328285006775241,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "S", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AGT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01112298771236303,
"Nucleotide GTR":0.0108475959396789,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "F", "Q", "V", "Y", "G", "F", "L", "Y", "L", "F", "F", "T", "R", "V", "E", "A", "F", "S", "L", "F", "R", "A", "C", "F", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TTT", "CAA", "GTT", "TAT", "GGT", "TTC", "CTT", "TAC", "TTG", "TTT", "TTC", "ACC", "CGC", "GTA", "GAA", "GCT", "TTT", "AGT", "CTT", "TTT", "CGT", "GCT", "TGT", "TTT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1.5, 1, 1, 1.5, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0.5, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004574496549821941,
"Nucleotide GTR":0.004461237527464783,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "K", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "E", "A", "Q", "P", "C", "S", "E", "K", "A", "K", "K", "I", "Q", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "AAA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAA", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAA", "AAA", "GCA", "AAA", "AAA", "ATA", "CAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "QH", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAW", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924397695,
"Nucleotide GTR":0.0006326716328834575,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCC", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "LF", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTK", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCW", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTR", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "AS", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "KCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487596657891967,
"Nucleotide GTR":0.0006326971582122916,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "V", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "GTA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487182682275924,
"Nucleotide GTR":0.0006326567856044295,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTC", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486596155713622,
"Nucleotide GTR":0.0006325995851172912,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001298666118587579,
"Nucleotide GTR":0.001266512710369287,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "V", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GTT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486831891197942,
"Nucleotide GTR":0.0006326225750130706,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGA", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435637_California_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091328293346,
"Nucleotide GTR":0.0006326478763876247,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "T", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ACA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435637_California_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTY", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "VF", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "KTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007141979031,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661913633,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "S", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "TCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487007141979031,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661913633,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "F", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "TTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487793185770762,
"Nucleotide GTR":0.0006327163244208244,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "C", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TGT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487334922840221,
"Nucleotide GTR":0.0006326716327315663,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAC", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "EG", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GRA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924876586,
"Nucleotide GTR":0.0006326716329301616,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "L", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "CTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGY", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000648912636999164,
"Nucleotide GTR":0.0006328463420394296,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCG", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAT", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "IV", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "RTA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490497751286996,
"Nucleotide GTR":0.0006329800847941271,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "E", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAA", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487596657317486,
"Nucleotide GTR":0.0006326971581562659,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAG", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":6.251409169111715e-06,
"Nucleotide GTR":6.096631810961623e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAC", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "KN", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAM", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "LF", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "YTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGY", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006493160438704334,
"Nucleotide GTR":0.0006332397610426669,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "N", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTY", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AAT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "TI", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "AYT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091328293346,
"Nucleotide GTR":0.0006326478763876247,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAC", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000648858633178667,
"Nucleotide GTR":0.0006327936752884529,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "M", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ATG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436658_California_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["AV", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GYT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436658_California_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006489352754954022,
"Nucleotide GTR":0.0006328684200337791,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "S", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "AGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436671_California_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030691823,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533520821,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAT", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAY", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490252183333279,
"Nucleotide GTR":0.0006329561359954172,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGY", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436940_LA_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487007141855755,
"Nucleotide GTR":0.00063263966617934,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "I", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "ATA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436940_LA_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091327837666,
"Nucleotide GTR":0.0006326478763431848,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTC", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489023395088068,
"Nucleotide GTR":0.0006328362995025253,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "S", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "AGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487280698638594,
"Nucleotide GTR":0.0006326663445639928,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486439717736446,
"Nucleotide GTR":0.0006325843286411546,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "F", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTT", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006492665490944048,
"Nucleotide GTR":0.0006331914916976511,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "H", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CAT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488915134769595,
"Nucleotide GTR":0.0006328257415101812,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "I", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ATA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488482774379341,
"Nucleotide GTR":0.0006327835759433823,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAC", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437557_California_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924449457,
"Nucleotide GTR":0.0006326716328885064,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "T", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ACG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437557_California_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437571_California_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437571_California_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437597_California_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000648891513407077,
"Nucleotide GTR":0.0006328257414420289,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "TTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437597_California_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "TM", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "AYG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488920089558611,
"Nucleotide GTR":0.0006328262247216218,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "N", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "AAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924980328,
"Nucleotide GTR":0.0006326716329402779,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "CTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488915134769595,
"Nucleotide GTR":0.0006328257415101812,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAT", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488482774379341,
"Nucleotide GTR":0.0006327835759433823,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGC", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006485426449177912,
"Nucleotide GTR":0.0006324855105161546,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTC", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "MV", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "RTG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGY", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "TI", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "AYT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133945463,
"Nucleotide GTR":0.0006328257414298082,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "TTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "SF", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TYT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "AV", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GYT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438597_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "T", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ACC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438597_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438625_England_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006486339598745915,
"Nucleotide GTR":0.000632574564624658,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "T", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ACC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438625_England_20200421_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438717_England_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006494304307814461,
"Nucleotide GTR":0.0006333513158715973,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGG", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438717_England_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006490512298449588,
"Nucleotide GTR":0.0006329815034933649,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "Y", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TAT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTT", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487349116424797,
"Nucleotide GTR":0.0006326730169484192,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "F", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TTC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006485149095030964,
"Nucleotide GTR":0.0006324584617969072,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACC", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439709_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAA", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439709_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439807_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488268379747084,
"Nucleotide GTR":0.0006327626672954321,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAG", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439807_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440303_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "IL", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "MTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440303_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440403_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCK", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440403_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440995_England_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACT", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440995_England_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440999_England_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440999_England_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441037_England_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "L", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CTT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441037_England_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441296_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486452366370581,
"Nucleotide GTR":0.000632585562188074,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441296_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "RC", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "YGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488813980903802,
"Nucleotide GTR":0.0006328158765683849,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "V", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GTT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441884_England_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487677135199887,
"Nucleotide GTR":0.0006327050066909673,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCC", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441884_England_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441927_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006485947823731004,
"Nucleotide GTR":0.0006325363571108947,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTC", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441927_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442005_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486207363955748,
"Nucleotide GTR":0.0006325616685430477,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGT", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442005_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442155_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487496092166708,
"Nucleotide GTR":0.0006326873506283837,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCC", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442155_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442392_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487007142044008,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661977004,
"amino-acid": [
["S", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442392_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442516_England_20200408_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0006487357139281315,
"Nucleotide GTR":0.0006326737993704448,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "I", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATT", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442516_England_20200408_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442641_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487182682523159,
"Nucleotide GTR":0.0006326567856285405,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "S", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TCG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442641_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442700_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007142044008,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661977004,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "L", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "TTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442700_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442736_England_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":5.110710567350151e-06,
"Nucleotide GTR":4.984175532050803e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "Y", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "TAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442736_England_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "S", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "TCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "HY", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "YAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAC", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000649050173785621,
"Nucleotide GTR":0.0006329804735807836,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAA", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487444412637764,
"Nucleotide GTR":0.0006326823106277753,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTG", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444054_California_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489759688374904,
"Nucleotide GTR":0.0006329081058577531,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCT", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444054_California_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444057_California_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAT", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444057_California_20200428_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444065_California_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487952612780856,
"Nucleotide GTR":0.0006327318723997679,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444065_California_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444069_California_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTR", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444069_California_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648937989718163,
"Nucleotide GTR":0.0006328710670556556,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTT", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444125_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444151_England_20200409_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006487954611711883,
"Nucleotide GTR":0.0006327320673437587,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAT", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444151_England_20200409_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444173_England_20200411_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "F", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "TTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444173_England_20200411_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444184_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487152231361394,
"Nucleotide GTR":0.0006326538159057715,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCC", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444184_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444198_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486239459558765,
"Nucleotide GTR":0.0006325647986385044,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "L", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "CTC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444198_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444220_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487152233525838,
"Nucleotide GTR":0.0006326538161168574,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "T", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ACC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444220_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444242_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488674434004656,
"Nucleotide GTR":0.0006328022673797761,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "L", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CTA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444242_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444265_England_20200418_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGT", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444265_England_20200418_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488514539801202,
"Nucleotide GTR":0.0006327866738382114,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "M", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATG", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444282_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444328_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006496670487914695,
"Nucleotide GTR":0.0006335820755048145,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTT", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444328_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444342_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444348_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":3.063507046864776e-05,
"Nucleotide GTR":2.987658303875635e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444348_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444451_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488401038087524,
"Nucleotide GTR":0.0006327756046834102,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444451_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488744600911533,
"Nucleotide GTR":0.000632809110345658,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "R", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AGA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488162954792475,
"Nucleotide GTR":0.0006327523858194551,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489233130763047,
"Nucleotide GTR":0.0006328567537897635,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "I", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "ATT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006489034753035198,
"Nucleotide GTR":0.0006328374071763285,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "L", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CTA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488974945173023,
"Nucleotide GTR":0.0006328315744671718,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAT", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAT", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007148380999,
"Nucleotide GTR":0.000632639666815709,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "C", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGT", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488945040419861,
"Nucleotide GTR":0.0006328286580324205,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCT", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487007146741735,
"Nucleotide GTR":0.0006326396666558417,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "Y", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "TAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488825407910405,
"Nucleotide GTR":0.0006328169909771534,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "S", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "TCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007141979031,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661913633,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCT", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006492665490982843,
"Nucleotide GTR":0.0006331914917014351,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "N", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "AAT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488323380667789,
"Nucleotide GTR":0.0006327680312118508,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCT", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445174_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445182_California_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489378922433792,
"Nucleotide GTR":0.000632870971994229,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445182_California_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445288_Punta_Arenas_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487596657317486,
"Nucleotide GTR":0.0006326971581562659,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "V", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "GTT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445288_Punta_Arenas_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445298_Rancagua_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGM", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445298_Rancagua_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":9.107678283926395e-05,
"Nucleotide GTR":8.882183144265359e-05,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "L", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTG", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445338_Temuco_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGY", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445338_Temuco_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445373_Santiago_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488885227112288,
"Nucleotide GTR":0.0006328228247922058,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAT", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445373_Santiago_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445553_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAY", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445553_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445573_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "PS", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "YCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445573_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445629_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648735305814083,
"Nucleotide GTR":0.0006326734013608084,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "V", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "GTA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445629_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCY", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445873_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTY", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445873_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445946_Wales_20200401_null_17":{
"Global MG94xREV":0.000648771269382372,
"Nucleotide GTR":0.0006327084745144818,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "L", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "TTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445946_Wales_20200401_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447046_Gujarat_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490063956109642,
"Nucleotide GTR":0.0006329377793009786,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCT", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447046_Gujarat_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447064_Michigan_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "SG", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "RGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447064_Michigan_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447119_Temuco_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006502403693599471,
"Nucleotide GTR":0.0006341412013468612,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "-", "A", "S", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "A", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "---", "GCA", "TCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GCT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447119_Temuco_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447133_Li_ge_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488855319215871,
"Nucleotide GTR":0.0006328199080509114,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "Y", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "TAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447133_Li_ge_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447152_Li_ge_20200418_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACT", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447152_Li_ge_20200418_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447153_Li_ge_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006495182345738426,
"Nucleotide GTR":0.0006334369457478969,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "DAGV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GNT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447153_Li_ge_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447173_Michigan_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "AV", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GYT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447173_Michigan_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447214_Michigan_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAR", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447214_Michigan_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAR", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489203125170595,
"Nucleotide GTR":0.0006328538275207498,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "F", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TTC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447303_South_Coast_District_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487007139215226,
"Nucleotide GTR":0.0006326396659218254,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "Y", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "TAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447303_South_Coast_District_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447306_South_Coast_District_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006266264805835454,
"Nucleotide GTR":0.0006111119640020955,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "L", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "TTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447306_South_Coast_District_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447314_Tel_Aviv_District_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGT", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447314_Tel_Aviv_District_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447341_Jerusalem_District_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488744603097395,
"Nucleotide GTR":0.0006328091105588324,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAG", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447341_Jerusalem_District_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447357_Jerusalem_District_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007141979031,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661913633,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "N", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAT", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447357_Jerusalem_District_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447390_North_District_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489069135254573,
"Nucleotide GTR":0.0006328407602720346,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "I", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ATA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447390_North_District_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447402_North_District_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490512745962551,
"Nucleotide GTR":0.0006329815471366729,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "S", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "TCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447402_North_District_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447404_North_District_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489263038981096,
"Nucleotide GTR":0.0006328596705624253,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "I", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "ATT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447404_North_District_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447412_Jerusalem_District_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488842157306723,
"Nucleotide GTR":0.0006328186244472971,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "N", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAT", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447412_Jerusalem_District_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "DY", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "KAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447521_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487007141979031,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661913633,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "C", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "TGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447521_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447524_Comunitat_Valenciana_20200401_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006487023222916552,
"Nucleotide GTR":0.0006326412344706511,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447524_Comunitat_Valenciana_20200401_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000648921137096411,
"Nucleotide GTR":0.0006328546316845097,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "L", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "TTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447573_Telangana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488155949874734,
"Nucleotide GTR":0.0006327517026710129,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCC", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447573_Telangana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447575_Telangana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "S", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "TCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447575_Telangana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447579_Telangana_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490553749476792,
"Nucleotide GTR":0.0006329855459683365,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "S", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "TCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447579_Telangana_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488255102383674,
"Nucleotide GTR":0.0006327613724322426,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "F", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "TTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447593_New_Taipei_City_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006499045925249395,
"Nucleotide GTR":0.0006338137379416803,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "Q", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "CAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447593_New_Taipei_City_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447722_France_20200301_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "L", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CTT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447722_France_20200301_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447757_Tolima_20200331_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0006487021619186889,
"Nucleotide GTR":0.0006326410780683255,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAT", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447757_Tolima_20200331_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "S", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "TCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447815_Cundinamarca_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006488795498606115,
"Nucleotide GTR":0.0006328140740985571,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACT", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447815_Cundinamarca_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447848_Telangana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006490043360717392,
"Nucleotide GTR":0.0006329357707534641,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "L", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CTT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTT", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447848_Telangana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447887_California_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487741375242516,
"Nucleotide GTR":0.000632711271644625,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "I", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ATA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447887_California_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.1715970873401856,
"Nucleotide GTR":0.1673485502301857,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "A", "L", "-", "-", "-", "G", "L", "P", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "M", "S", "E", "E", "L", "G", "N", "L", "S", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "A", "N", "N", "A", "A", "L", "T", "T", "M", "C", "-", "T", "F", "L", "Q", "A", "A", "L", "I", "F", "S", "S", "S", "P", "I", "I", "G", "Y", "S", "I", "V", "Q", "S", "T", "R", "L", "T", "K", "H", "S", "W", "T", "A", "R", "H", "L", "V", "M", "I", "A", "S", "Q", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "A", "T", "C", "A", "L", "P", "W", "T", "-", "Q", "Y", "R", "S", "W", "L", "L", "C", "KQE", "V", "T", "C", "K", "T", "P", "L", "L", "N", "I", "N", "H", "K", "R", "I", "I", "D", "V", "I", "K", "S", "N", "R", "M", "M", "P", "T", "G", "I", "S", "V", "-", "S", "S", "G", "K", "A", "C", "G", "T", "S", "I", "T", "-", "T", "T", "G", "A", "L", "R", "S", "Y", "F", "H", "K", "I", "L", "H", "R", "C", "Q", "L", "K", "A", "M", "C", "P", "-", "D", "K", "Y", "D", "S", "V", "R", "E", "I", "F", "K", "C", "V", "T", "-", "H", "L", "Y", "N", "L", "Y", "T", "H", "Y", "I", "P", "R", "K", "S", "F", "V", "H", "K", "-", "-", "W", "Y", "E", "V", "F", "K", "L", "I", "S", "R", "R", "W", "F", "S", "T", "N", "S", "G", "K", "I", "C", "I", "I", "R", "C", "I", "N", "I", "T", "C", "R", "Y", "S", "N", "-", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "GCT", "TTA", "---", "---", "---", "GGG", "TTA", "CCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATG", "TCG", "GAA", "GAA", "CTG", "GGC", "AAT", "TTG", "TCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GCT", "AAT", "AAT", "GCA", "GCT", "TTA", "ACA", "ACC", "ATG", "TGT", "---", "ACC", "TTT", "CTA", "CAA", "GCC", "GCA", "TTA", "ATC", "TTC", "AGT", "TCA", "TCA", "CCA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAT", "TCA", "ATA", "GTC", "CAG", "TCA", "ACA", "CGC", "TTA", "ACA", "AAG", "CAC", "TCG", "TGG", "ACA", "GCT", "AGA", "CAC", "CTA", "GTC", "ATG", "ATT", "GCA", "TCA", "CAA", "CTA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GCT", "ACA", "TGT", "GCA", "TTA", "CCA", "TGG", "ACT", "---", "CAA", "TAC", "AGA", "TCA", "TGG", "TTG", "CTT", "TGT", "-AG", "GTT", "ACC", "TGT", "AAA", "ACC", "CCA", "TTG", "TTG", "AAC", "ATC", "AAT", "CAT", "AAA", "CGG", "ATT", "ATA", "GAC", "GTA", "ATC", "AAA", "TCC", "AAT", "AGA", "ATG", "ATG", "CCA", "ACA", "GGC", "ATA", "AGT", "GTC", "---", "AGC", "AGT", "GGA", "AAA", "GCA", "TGT", "GGC", "ACG", "TCT", "ATC", "ACA", "---", "ACA", "ACA", "GGT", "GCG", "CTC", "AGG", "TCC", "TAT", "TTT", "CAC", "AAA", "ATA", "CTT", "CAT", "AGA", "TGT", "CAA", "CTC", "AAA", "GCC", "ATG", "TGC", "CCA", "---", "GAC", "AAA", "TAC", "GAC", "TCT", "GTC", "AGA", "GAG", "ATT", "TTT", "AAG", "TGT", "GTC", "ACT", "---", "CAT", "TTG", "TAC", "AAT", "CTT", "TAT", "ACG", "CAC", "TAC", "ATT", "CCA", "AGG", "AAG", "TCC", "TTT", "GTA", "CAT", "AAG", "---", "---", "TGG", "TAT", "GAG", "GTG", "TTT", "AAA", "TTG", "ATC", "TCC", "AGG", "CGG", "TGG", "TTT", "AGC", "ACT", "AAC", "TCT", "GGA", "AAA", "ATC", "TGT", "ATT", "ATT", "AGG", "TGT", "ATC", "AAC", "ATA", "ACC", "TGT", "AGG", "TAC", "AGC", "AAC", "---", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 2.5, 1, 2, 0, 2.666666666666667, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2.333333333333333, 1.5, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1.5, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.333333333333333, 1.5, 1, 2.333333333333333, 1, 0, 2.5, 0, 2.333333333333333, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2.5, 2.166666666666667, 2.166666666666667, 1.5, 0, 2.5, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 2.333333333333333, 2.5, 0, 2, 0, 0, 2.666666666666667, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.333333333333333, 0, 0, 2.5, 0, 1.5, 2, 1, 0, 0, 2, 1.5, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 2, 2, 1.5, 0, 1, 2, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 2, 2.5, 0, 0, 0, 2, 2.833333333333333, 1, 1, 2.5, 1.5, 0, 2, 2.833333333333333, 2, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 2.333333333333333, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0.5, 0, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0.6666666666666666, 0.5, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0.5, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0.6666666666666666, 0.5, 1, 0.6666666666666666, 1, 0, 0.5, 1, 0.6666666666666666, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0.8333333333333334, 0.8333333333333334, 0.5, 1, 0.5, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0.6666666666666666, 0.5, 1, 0, 1, 0, 0.3333333333333333, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.6666666666666666, 0, 0, 0.5, 1, 1.5, 0, 1, 0, 1, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0.5, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0.1666666666666667, 1, 0, 0.5, 0.5, 1, 1, 0.1666666666666667, 1, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6666666666666666, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448049_England_20200506_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133894275,
"Nucleotide GTR":0.000632825741424816,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAT", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448049_England_20200506_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448052_England_20200504_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006488930431101075,
"Nucleotide GTR":0.0006328272332714552,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448052_England_20200504_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448054_England_20200502_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "V", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448054_England_20200502_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448114_England_20200506_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTT", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448114_England_20200506_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448150_Scotland_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006237427256575675,
"Nucleotide GTR":0.0006082996073731931,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "I", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "ATA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448150_Scotland_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448171_Scotland_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486664943893505,
"Nucleotide GTR":0.000632606293624035,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "F", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAC", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TTC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448171_Scotland_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448221_Scotland_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":6.251404173565965e-06,
"Nucleotide GTR":6.096626939099565e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAC", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448221_Scotland_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448297_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "HD", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "SAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448297_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448318_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGY", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448318_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448332_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "PL", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CYA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448332_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448336_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489497522661009,
"Nucleotide GTR":0.0006328825383770799,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "C", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "TGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448336_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448339_England_20200423_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006487334924980328,
"Nucleotide GTR":0.0006326716329402779,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "L", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "CTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448339_England_20200423_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448344_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000648858303040862,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533244624,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448344_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448380_England_20200502_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448380_England_20200502_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448383_England_20200502_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006487474376062123,
"Nucleotide GTR":0.0006326852327843834,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGT", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448383_England_20200502_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448430_England_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006489022027845829,
"Nucleotide GTR":0.0006328361661634282,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "T", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "ACT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448430_England_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448443_England_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006485841583734188,
"Nucleotide GTR":0.0006325259961486439,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAC", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448443_England_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448466_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "GV", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GKT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448466_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448477_England_20200405_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006489786801831573,
"Nucleotide GTR":0.0006329107500737676,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTC", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448477_England_20200405_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448488_England_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "C", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "TGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448488_England_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448490_England_20200405_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133894275,
"Nucleotide GTR":0.000632825741424816,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTT", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448490_England_20200405_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448555_England_20200407_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133195447,
"Nucleotide GTR":0.0006328257413566636,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTT", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448555_England_20200407_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448664_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "S", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "TCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448664_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448666_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489302894219213,
"Nucleotide GTR":0.0006328635574094695,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTA", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448666_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448692_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489803701403903,
"Nucleotide GTR":0.0006329123981896961,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAT", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTT", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448692_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448721_England_20200101_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "I", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATT", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448721_England_20200101_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448735_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648658973317725,
"Nucleotide GTR":0.0006325989587650804,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "Y", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "A", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "TAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GCA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448735_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448738_England_20200101_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448738_England_20200101_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448761_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486961215164394,
"Nucleotide GTR":0.0006326351872191573,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "A", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GCA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAT", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448761_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448772_England_20200101_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "A", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GCA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448772_England_20200101_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448777_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "L", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CTT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAC", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448777_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448785_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488385894141487,
"Nucleotide GTR":0.0006327741277833921,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "S", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "TCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCG", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448785_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448790_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006489022026738355,
"Nucleotide GTR":0.0006328361660554218,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "K", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AAA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448790_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448799_England_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAC", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448799_England_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448802_England_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006487962957379983,
"Nucleotide GTR":0.0006327328812477001,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "Y", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "TAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448802_England_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448845_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487007139215226,
"Nucleotide GTR":0.0006326396659218254,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "I", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATT", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448845_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448875_England_20200414_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006486976044928089,
"Nucleotide GTR":0.0006326366334788191,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "I", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "ATC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448875_England_20200414_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448881_England_20200417_null_48":{
"Global MG94xREV":0.0006486836523724543,
"Nucleotide GTR":0.0006326230267961526,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "V", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GTC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448881_England_20200417_null_48",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448924_Northern_Ireland_20200326_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006488583029593029,
"Nucleotide GTR":0.0006327933532449228,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "C", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "TGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448924_Northern_Ireland_20200326_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448932_Northern_Ireland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000623742725640641,
"Nucleotide GTR":0.0006082996073566856,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "I", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "ATT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448932_Northern_Ireland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449011_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "YS", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TMT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449011_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449014_England_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTY", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449014_England_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449025_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "PS", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "YCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449025_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449063_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "QH", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAK", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449063_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449117_England_20200408_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133246646,
"Nucleotide GTR":0.0006328257413616557,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "S", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "TCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449117_England_20200408_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449131_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449131_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449143_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488430955451969,
"Nucleotide GTR":0.0006327785223480666,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCG", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449143_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449148_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487780234387747,
"Nucleotide GTR":0.0006327150613485865,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "Y", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "TAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449148_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449171_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488595593890032,
"Nucleotide GTR":0.0006327945785669376,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "C", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "L", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "TGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TTA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449171_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449206_Scotland_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030596274,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533427639,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAT", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449206_Scotland_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449214_Scotland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487007148257706,
"Nucleotide GTR":0.0006326396668036858,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "S", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "TCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449214_Scotland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449217_Scotland_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":5.10113987268011e-06,
"Nucleotide GTR":4.974841796248213e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTT", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449217_Scotland_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449220_Scotland_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006487007148257706,
"Nucleotide GTR":0.0006326396668036858,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "I", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATT", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449220_Scotland_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "V", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GTT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449257_Scotland_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487007142044008,
"Nucleotide GTR":0.0006326396661977004,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "L", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CTT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449257_Scotland_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449300_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006486319658030635,
"Nucleotide GTR":0.0006325726199239383,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "I", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "C", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATT", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TGT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449300_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449478_Wuhan_20200122_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487334922788248,
"Nucleotide GTR":0.0006326716327264984,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCC", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449478_Wuhan_20200122_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449632_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091327467901,
"Nucleotide GTR":0.0006326478763071232,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "CTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449632_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449635_England_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "TTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449635_England_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449639_England_20200404_null_50":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "I", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ATA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449639_England_20200404_null_50",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449673_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648902539084,
"Nucleotide GTR":0.000632836494136476,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "K", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "AAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449673_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449695_England_20200415_null_4":{
"Global MG94xREV":5.1011519723076e-06,
"Nucleotide GTR":4.974853596303505e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAT", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449695_England_20200415_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449726_England_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "L", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "CTC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449726_England_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449728_England_20200417_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006486976057740719,
"Nucleotide GTR":0.0006326366347283602,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "F", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "TTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449728_England_20200417_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449832_Utah_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "RL", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CKT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449832_Utah_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449867_Washington_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006486687858383588,
"Nucleotide GTR":0.0006326085283395276,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "F", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTT", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449867_Washington_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449907_Washington_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449907_Washington_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449959_Washington_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006488744600338421,
"Nucleotide GTR":0.0006328091102897655,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449959_Washington_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449966_Washington_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001298284449062905,
"Nucleotide GTR":0.001266140490522137,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "Y", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "S", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "TAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "TCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAT", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449966_Washington_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450023_New_York_20200318_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "I", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATT", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450023_New_York_20200318_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450076_New_York_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450076_New_York_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450119_New_York_20200308_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006489375163558434,
"Nucleotide GTR":0.0006328706054132157,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "N", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "AAT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450119_New_York_20200308_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "F", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "TTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450272_Saint_Petersburg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006489022026107195,
"Nucleotide GTR":0.0006328361659938683,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "I", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "ATT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450272_Saint_Petersburg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450308_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487353057723272,
"Nucleotide GTR":0.0006326734013200868,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "G", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GGT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450308_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450309_Quebec_20200327_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "T", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ACA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450309_Quebec_20200327_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_34":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_34",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006237427256578642,
"Nucleotide GTR":0.0006082996073734819,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "I", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "ATA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450412_Hong_Kong_20200130_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133894275,
"Nucleotide GTR":0.000632825741424816,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTT", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450412_Hong_Kong_20200130_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450451_California_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648976027216214,
"Nucleotide GTR":0.0006329081627910892,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "I", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATT", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450451_California_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450457_California_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006485621250343402,
"Nucleotide GTR":0.0006325045083284915,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAC", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450457_California_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450464_California_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006488583029542114,
"Nucleotide GTR":0.0006327933532399576,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "TTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450464_California_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006266264994272641,
"Nucleotide GTR":0.0006111119823792668,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "F", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "TTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450716_Wisconsin_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006266264994062712,
"Nucleotide GTR":0.0006111119823587938,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "L", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "TTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450716_Wisconsin_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450745_Ho_Chi_Minh_City_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "AV", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GYT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450745_Ho_Chi_Minh_City_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450754_Minnesota_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAC", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450754_Minnesota_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450786_Gujarat_20200510_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "N", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAT", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450786_Gujarat_20200510_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450816_Skane_20200422_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133945463,
"Nucleotide GTR":0.0006328257414298082,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "L", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CTT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450816_Skane_20200422_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451089_South_Australia_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGY", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451089_South_Australia_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451090_South_Australia_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "S", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "TCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451090_South_Australia_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451153_Gujarat_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000648858981852078,
"Nucleotide GTR":0.0006327940153291307,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "V", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GTT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451153_Gujarat_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451155_Gujarat_20200503_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "F", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "TTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451155_Gujarat_20200503_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451161_Gujarat_20200503_null_119":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTT", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451161_Gujarat_20200503_null_119",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451188_Uganda_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133246646,
"Nucleotide GTR":0.0006328257413616557,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "V", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GTT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451188_Uganda_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451193_Uganda_20200330_null_8":{
"Global MG94xREV":2.407899358828855e-06,
"Nucleotide GTR":2.348282672195656e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "G", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GGT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451193_Uganda_20200330_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451228_Louisiana_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488586374580083,
"Nucleotide GTR":0.000632793679461843,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "L", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CTG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451228_Louisiana_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451265_Louisiana_20200506_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487270406637155,
"Nucleotide GTR":0.0006326653408456042,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "V", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GTT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451265_Louisiana_20200506_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451273_Louisiana_20200508_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0006487353057616506,
"Nucleotide GTR":0.0006326734013096746,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "A", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "GCA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451273_Louisiana_20200508_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451312_Sichuan_20200126_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006504052514355989,
"Nucleotide GTR":0.0006343020011410009,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "SRGC", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTC", "-GT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451312_Sichuan_20200126_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451315_Sichuan_20200130_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "L", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CTT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451315_Sichuan_20200130_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451340_Sichuan_20200206_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006487596657793134,
"Nucleotide GTR":0.0006326971582026527,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACG", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451340_Sichuan_20200206_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451357_Sichuan_20200203_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006488583030596274,
"Nucleotide GTR":0.0006327933533427639,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "I", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ATA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451357_Sichuan_20200203_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451369_Sichuan_20200208_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488584939639147,
"Nucleotide GTR":0.0006327935395204906,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGT", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451369_Sichuan_20200208_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451389_Sichuan_20200130_null_4":{
"Global MG94xREV":5.091696248620717e-06,
"Nucleotide GTR":4.965631984941071e-06,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "F", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451389_Sichuan_20200130_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451397_Sichuan_20200131_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0006502066975163859,
"Nucleotide GTR":0.0006341083631775724,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "LF", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "TT-", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451397_Sichuan_20200131_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451420_New_York_20200321_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006488583716227547,
"Nucleotide GTR":0.000632793420208351,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "S", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "TCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451420_New_York_20200321_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451438_New_York_20200326_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006487007141855755,
"Nucleotide GTR":0.00063263966617934,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "F", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "TTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451438_New_York_20200326_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451465_New_York_20200321_null_8":{
"Global MG94xREV":0.000648683332835313,
"Nucleotide GTR":0.0006326227151703662,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451465_New_York_20200321_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006488915133894275,
"Nucleotide GTR":0.000632825741424816,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "F", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "TTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451502_New_South_Wales_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487091328347398,
"Nucleotide GTR":0.000632647876392896,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAC", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451502_New_South_Wales_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451511_New_South_Wales_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "V", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GTT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451511_New_South_Wales_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451554_New_South_Wales_20200402_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAT", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451554_New_South_Wales_20200402_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451571_New_South_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487091327923573,
"Nucleotide GTR":0.000632647876351563,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "A", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GCC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451571_New_South_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451610_New_South_Wales_20200402_null_234":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "V", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GTA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451610_New_South_Wales_20200402_null_234",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451611_New_South_Wales_20200324_null_1273":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTT", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451611_New_South_Wales_20200324_null_1273",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451631_New_South_Wales_20200326_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451631_New_South_Wales_20200326_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_206":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "L", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "CTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_206",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451636_New_South_Wales_20200310_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "S", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "TCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451636_New_South_Wales_20200310_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451644_Pomorze_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487353057616506,
"Nucleotide GTR":0.0006326734013096746,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "R", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CGC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451644_Pomorze_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451697_Bern_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "QP", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CMA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451697_Bern_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451706_Bern_20200316_null_78":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTT", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAA", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451706_Bern_20200316_null_78",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451707_Schwyz_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCY", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451707_Schwyz_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451713_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "PL", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CYT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451713_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451714_Vaud_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "AV", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GYC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451714_Vaud_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451741_Basel_Land_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006487793181746327,
"Nucleotide GTR":0.0006327163240283451,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "V", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "GTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451741_Basel_Land_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451748_Valais_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "N", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "EG", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAT", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GRA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451748_Valais_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451752_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "TS", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AST", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451752_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451759_Aargau_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTY", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451759_Aargau_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "TA", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "RCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "T", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "YF", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ACA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TWT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451764_Basel_Land_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TWA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451764_Basel_Land_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451776_Basel_Land_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "EG", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GRA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451776_Basel_Land_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451785_Basel_Land_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "KR", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "ARA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451785_Basel_Land_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451791_Graubunden_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "GV", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GKT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451791_Graubunden_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "AS", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "KCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451803_Basel_Stadt_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006487091327923573,
"Nucleotide GTR":0.000632647876351563,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCC", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451803_Basel_Stadt_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451810_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "PL", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CYA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451810_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "KT", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "AMA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451849_Jura_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAY", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451849_Jura_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451852_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAY", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451852_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451859_Basel_Land_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCR", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451859_Basel_Land_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451860_Valais_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "AV", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GYA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451860_Valais_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451863_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "GV", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GKA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451863_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451870_Graubunden_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAY", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451870_Graubunden_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAT", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451875_Glarus_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "EA", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GMG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451875_Glarus_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451879_Bern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "AV", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GYA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451879_Bern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451883_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "RS", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGW", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451883_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451885_Basel_Stadt_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "CF", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TKT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451885_Basel_Stadt_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451886_Bern_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGK", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451886_Bern_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAR", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451888_Vaud_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "DG", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GRT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451888_Vaud_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451895_Basel_Stadt_20200407_null_576":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "TTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451895_Basel_Stadt_20200407_null_576",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451909_Aargau_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "DY", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAT", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "KAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451909_Aargau_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451911_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCR", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451911_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "T", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ACA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAY", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451914_Vaud_20200407_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "YF", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TWT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451914_Vaud_20200407_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451915_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCR", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451915_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451948_Belarus_20200301_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "I", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ATT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451948_Belarus_20200301_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451976_Malopolska_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006487091328399814,
"Nucleotide GTR":0.0006326478763980076,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAC", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451976_Malopolska_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451977_Malopolska_20200403_null_16559":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTG", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451977_Malopolska_20200403_null_16559",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451987_Malopolska_20200401_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006486976044923705,
"Nucleotide GTR":0.0006326366334783916,
"amino-acid": [
["A", "E", "N", "V", "T", "G", "L", "F", "K", "D", "C", "S", "K", "V", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "Q", "A", "P", "T", "H", "L", "S", "V", "D", "T", "K", "F", "K", "T", "E", "G", "L", "C", "V", "D", "I", "P", "G", "I", "P", "K", "D", "M", "T", "Y", "R", "R", "L", "I", "S", "M", "M", "G", "F", "K", "M", "N", "Y", "Q", "V", "N", "G", "Y", "P", "N", "M", "F", "I", "T", "R", "E", "E", "A", "I", "R", "H", "V", "R", "A", "W", "I", "G", "F", "D", "V", "E", "G", "C", "H", "A", "T", "R", "E", "A", "V", "G", "T", "N", "L", "P", "L", "Q", "L", "G", "F", "S", "T", "G", "V", "N", "L", "V", "A", "V", "P", "T", "G", "Y", "V", "D", "T", "P", "N", "N", "T", "D", "F", "S", "R", "V", "S", "A", "K", "P", "P", "P", "G", "D", "Q", "F", "K", "H", "L", "I", "P", "L", "M", "Y", "K", "G", "L", "P", "W", "N", "V", "V", "R", "I", "K", "I", "V", "Q", "M", "L", "S", "D", "T", "L", "K", "N", "L", "S", "D", "R", "V", "V", "F", "V", "L", "W", "A", "H", "G", "F", "E", "L", "T", "S", "M", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "Y", "F", "V", "K", "I", "G", "P", "E", "R", "T", "C", "C", "L", "C", "D", "R", "R", "A", "T", "C", "F", "S", "T", "A", "S", "D", "T", "Y", "A", "C", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "H", "S", "I", "G", "F", "D", "Y", "V", "Y", "N", "-", "-", "-", "-", "P", "F", "M", "I", "D", "V", "Q", "Q", "W", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "T", "G", "N", "L", "Q", "S", "N", "-", "H", "D", "L", "Y", "-", "-", "C", "Q", "V", "H", "G", "N", "A", "H", "V", "A", "S", "C", "D", "A", "I", "-", "-", "M", "T", "R", "C", "L", "A", "V", "H", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "E", "C", "F", "V", "K", "R", "V", "D", "W", "T", "I", "E", "Y", "P", "I", "I", "G", "D", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "I", "N", "A", "A", "C", "R", "-", "-", "-", "K", "V", "Q", "H", "M", "V", "V", "K", "A", "A", "L", "L", "A", "D", "K", "F", "P", "V", "L", "H", "D", "I", "G", "N", "P", "K", "A", "I", "K", "C", "V", "P", "Q", "A", "D", "V", "E", "W", "K", "F", "Y", "D", "A", "Q", "P", "C", "S", "D", "K", "A", "Y", "K", "I", "E", "E", "L", "F", "Y", "S", "Y", "A", "T", "H", "S", "D", "K", "F", "T", "D", "G", "V", "C", "L", "F", "W", "N", "C", "N", "V", "D", "R", "Y", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "C", "R", "F", "D", "T", "R", "V", "L", "S", "N", "L", "N", "L", "P", "G", "C", "D", "G", "G", "S", "L", "Y", "V", "N", "K", "H", "A", "F", "H", "T", "P", "A", "F", "D", "K", "S", "A", "F", "V", "N", "L", "K", "Q", "L", "P", "F", "F", "Y", "Y", "S", "D", "S", "P", "C", "E", "S", "H", "G", "K", "Q", "V", "V", "S", "D", "I", "D", "Y", "V", "P", "L", "K", "S", "A", "T", "C", "I", "T", "R", "C", "N", "L", "G", "G", "A", "V", "C", "R", "H", "H", "A", "N", "E", "Y", "R", "L", "Y", "L", "D", "A", "Y", "N", "M", "M", "I", "S", "A", "G", "F", "S", "L", "W", "V", "Y", "K", "Q", "F", "D", "T", "Y", "N", "L", "W", "N", "T", "F", "T", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GAA", "AAT", "GTA", "ACA", "GGA", "CTC", "TTT", "AAA", "GAT", "TGT", "AGT", "AAG", "GTA", "ATC", "ACT", "GGG", "TTA", "CAT", "CCT", "ACA", "CAG", "GCA", "CCT", "ACA", "CAC", "CTC", "AGT", "GTT", "GAC", "ACT", "AAA", "TTC", "AAA", "ACT", "GAA", "GGT", "TTA", "TGT", "GTT", "GAC", "ATA", "CCT", "GGC", "ATA", "CCT", "AAG", "GAC", "ATG", "ACC", "TAT", "AGA", "AGA", "CTC", "ATC", "TCT", "ATG", "ATG", "GGT", "TTT", "AAA", "ATG", "AAT", "TAT", "CAA", "GTT", "AAT", "GGT", "TAC", "CCT", "AAC", "ATG", "TTT", "ATC", "ACC", "CGC", "GAA", "GAA", "GCT", "ATA", "AGA", "CAT", "GTA", "CGT", "GCA", "TGG", "ATT", "GGC", "TTC", "GAT", "GTC", "GAG", "GGG", "TGT", "CAT", "GCT", "ACT", "AGA", "GAA", "GCT", "GTT", "GGT", "ACC", "AAT", "TTA", "CCT", "TTA", "CAG", "CTA", "GGT", "TTT", "TCT", "ACA", "GGT", "GTT", "AAC", "CTA", "GTT", "GCT", "GTA", "CCT", "ACA", "GGT", "TAT", "GTT", "GAT", "ACA", "CCT", "AAT", "AAT", "ACA", "GAT", "TTT", "TCC", "AGA", "GTT", "AGT", "GCT", "AAA", "CCA", "CCG", "CCT", "GGA", "GAT", "CAA", "TTT", "AAA", "CAC", "CTC", "ATA", "CCA", "CTT", "ATG", "TAC", "AAA", "GGA", "CTT", "CCT", "TGG", "AAT", "GTA", "GTG", "CGT", "ATA", "AAG", "ATT", "GTA", "CAA", "ATG", "TTA", "AGT", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "TCT", "GAC", "AGA", "GTC", "GTA", "TTT", "GTC", "TTA", "TGG", "GCA", "CAT", "GGC", "TTT", "GAG", "TTG", "ACA", "TCT", "ATG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "TAT", "TTT", "GTG", "AAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CGC", "ACC", "TGT", "TGT", "CTA", "TGT", "GAT", "AGA", "CGT", "GCC", "ACA", "TGC", "TTT", "TCC", "ACT", "GCT", "TCA", "GAC", "ACT", "TAT", "GCC", "TGT", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "CAT", "TCT", "ATT", "GGA", "TTT", "GAT", "TAC", "GTC", "TAT", "AAT", "---", "---", "---", "---", "CCG", "TTT", "ATG", "ATT", "GAT", "GTT", "CAA", "CAA", "TGG", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "ACA", "GGT", "AAC", "CTA", "CAA", "AGC", "AAC", "---", "CAT", "GAT", "CTG", "TAT", "---", "---", "TGT", "CAA", "GTC", "CAT", "GGT", "AAT", "GCA", "CAT", "GTA", "GCT", "AGT", "TGT", "GAT", "GCA", "ATC", "---", "---", "ATG", "ACT", "AGG", "TGT", "CTA", "GCT", "GTC", "CAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GAG", "TGC", "TTT", "GTT", "AAG", "CGT", "GTT", "GAC", "TGG", "ACT", "ATT", "GAA", "TAT", "CCT", "ATA", "ATT", "GGT", "GAT", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAG", "ATT", "AAT", "GCG", "GCT", "TGT", "AGA", "---", "---", "---", "AAG", "GTT", "CAA", "CAC", "ATG", "GTT", "GTT", "AAA", "GCT", "GCA", "TTA", "TTA", "GCA", "GAC", "AAA", "TTC", "CCA", "GTT", "CTT", "CAC", "GAC", "ATT", "GGT", "AAC", "CCT", "AAA", "GCT", "ATT", "AAG", "TGT", "GTA", "CCT", "CAA", "GCT", "GAT", "GTA", "GAA", "TGG", "AAG", "TTC", "TAT", "GAT", "GCA", "CAG", "CCT", "TGT", "AGT", "GAC", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "ATA", "GAA", "GAA", "TTA", "TTC", "TAT", "TCT", "TAT", "GCC", "ACA", "CAT", "TCT", "GAC", "AAA", "TTC", "ACA", "GAT", "GGT", "GTA", "TGC", "CTA", "TTT", "TGG", "AAT", "TGC", "AAT", "GTC", "GAT", "AGA", "TAT", "CCT", "GCT", "AAT", "TCC", "ATT", "GTT", "TGT", "AGA", "TTT", "GAC", "ACT", "AGA", "GTT", "CTA", "TCT", "AAC", "CTT", "AAC", "TTG", "CCT", "GGT", "TGT", "GAT", "GGT", "GGC", "AGT", "TTG", "TAT", "GTA", "AAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTC", "CAC", "ACA", "CCA", "GCT", "TTT", "GAT", "AAA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "AAT", "TTA", "AAA", "CAA", "TTA", "CCA", "TTT", "TTC", "TAT", "TAC", "TCT", "GAC", "AGT", "CCA", "TGT", "GAG", "TCT", "CAT", "GGA", "AAA", "CAA", "GTA", "GTG", "TCA", "GAT", "ATA", "GAT", "TAT", "GTA", "CCA", "CTA", "AAG", "TCT", "GCT", "ACG", "TGT", "ATA", "ACA", "CGT", "TGC", "AAT", "TTA", "GGT", "GGT", "GCT", "GTC", "TGT", "AGA", "CAT", "CAT", "GCT", "AAT", "GAG", "TAC", "AGA", "TTG", "TAT", "CTC", "GAT", "GCT", "TAT", "AAC", "ATG", "ATG", "ATC", "TCA", "GCT", "GGC", "TTT", "AGC", "TTG", "TGG", "GTT", "TAC", "AAA", "CAA", "TTT", "GAT", "ACT", "TAT", "AAC", "CTC", "TGG", "AAC", "ACT", "TTT", "ACA", "AGA", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451987_Malopolska_20200401_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":16663.6473960465,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02958828500938069],
[0.01559316685342846],
[0.01206319205138611],
[0.04275047242511758],
[0.01706575375221843],
[0.008993733352693382],
[0.006957735635891215],
[0.02465736134983009],
[0.01621577061955392],
[0.0085457882012243],
[0.006611196126537433],
[0.02342926785055264],
[0.02362516113580873],
[0.01245057222522373],
[0.009632016723370374],
[0.03413468537818747],
[0.01764229124620467],
[0.009297571352703685],
[0.007192790912416231],
[0.02549036840755213],
[0.01017561504281824],
[0.005362597499267583],
[0.004148614847517286],
[0.0147021819669067],
[0.009668804662423624],
[0.005095506019581035],
[0.003941987428915701],
[0.01396991974944617],
[0.01408672295012401],
[0.007423769958605697],
[0.005743179919624917],
[0.02035312492253677],
[0.03052346922151965],
[0.01608601337879996],
[0.01244446817978894],
[0.04410166823997392],
[0.01760514369902562],
[0.009277994418752461],
[0.007177645796850499],
[0.0254366959763573],
[0.01672829551466919],
[0.008815891257333655],
[0.006820153362109953],
[0.02416978665347972],
[0.02437187145364035],
[0.01284409211234911],
[0.009936451737697787],
[0.03521356571349215],
[0.01541961961639089],
[0.042274672580149],
[0.01687581706780399],
[0.008893635817107179],
[0.006880298139903585],
[0.02438293236596019],
[0.008450676159868524],
[0.006537615510613872],
[0.02316850717637421],
[0.02336222022853654],
[0.01231200111715217],
[0.009524815286667147],
[0.03375477664058366]
],
"Log Likelihood":-7580.343615091305,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.5418633507590467, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5003366763318602, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":750
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":17890.99123335398,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2935087602219701],
[0.1826022453683503],
[0.1997541080384597],
[0.3241348863712198]
],
"Log Likelihood":-7707.155421660741,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3699890703505884,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.489626131642057,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.2499783070833276,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.553561681430141,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.8900457723979791
},
"display order":0,
"estimated parameters":1237
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-26/sequences.exonuclease.compressed.fas",
"number of sequences":616,
"number of sites":619,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1,epi_isl_438625_England_20200421_null_5,epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7,epi_isl_439807_England_20200412_null_1,epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1,epi_isl_441884_England_20200430_null_2,epi_isl_442155_England_20200404_null_1,epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2,epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2,epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1,epi_isl_445288_Punta_Arenas_20200320_null_1,epi_isl_445373_Santiago_20200403_null_2,epi_isl_447133_Li_ge_20200324_null_2,epi_isl_447404_North_District_20200401_null_1,epi_isl_447815_Cundinamarca_20200406_null_3,epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1,epi_isl_442641_England_20200405_null_1,epi_isl_444242_England_20200418_null_1,epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2,epi_isl_444220_England_20200415_null_1,epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_449143_England_20200408_null_2,epi_isl_444184_England_20200414_null_1,epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4,(epi_isl_448761_England_20200101_null_1,epi_isl_448735_England_20200101_null_1,epi_isl_448772_England_20200101_null_20)Node1197,epi_isl_444151_England_20200409_null_11,epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1,((epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1,epi_isl_439709_England_20200408_null_4)Node1189,epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3)Node1188,epi_isl_445946_Wales_20200401_null_17,(epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1,epi_isl_448785_England_20200408_null_2)Node1182,epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1,epi_isl_433793_England_20200406_null_1,epi_isl_451438_New_York_20200326_null_6,epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_2,epi_isl_449632_England_20200404_null_1,epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1,epi_isl_451644_Pomorze_20200502_null_1,epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1,epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1,epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2,epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1,epi_isl_436671_California_20200418_null_2,epi_isl_451976_Malopolska_20200407_null_3,epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1,epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2,epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1,epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1,epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5,epi_isl_425491_England_20200318_null_2,epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1,epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1,epi_isl_448790_England_20200408_null_2,epi_isl_420727_England_20200328_null_1,epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1,epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9,epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1,epi_isl_451741_Basel_Land_20200325_null_1,epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3,epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1,epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2,epi_isl_425279_England_20200330_null_1,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1,epi_isl_423136_England_20200323_null_1,epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1,epi_isl_450308_Quebec_20200327_null_1,epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1,epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2,epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3,epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1,epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1,(epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2,epi_isl_449300_Scotland_20200424_null_1)Node422,epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1,epi_isl_451273_Louisiana_20200508_null_13,epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1,epi_isl_437597_California_20200326_null_3,epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2,epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1,epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1,(epi_isl_442005_England_20200411_null_1,epi_isl_447314_Tel_Aviv_District_20200405_null_4)Node438,(epi_isl_423469_England_20200331_null_1,epi_isl_440999_England_20200402_null_4)Node434,epi_isl_442516_England_20200408_null_12,epi_isl_423808_England_20200323_null_1,epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1,epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1,epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1,epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1,epi_isl_433858_England_20200408_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_451977_Malopolska_20200403_null_16559,epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2,epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_447303_South_Coast_District_20200324_null_2,epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1,epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3,epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3,epi_isl_447064_Michigan_20200403_null_1,(epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1,epi_isl_450119_New_York_20200308_null_3,epi_isl_451948_Belarus_20200301_null_10)Node462,epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1,epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1,epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2,epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_441927_England_20200411_null_1,(epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1,epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2)Node1170,epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1,(epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1,epi_isl_449217_Scotland_20200428_null_3)Node1164,(epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1)Node1161,epi_isl_451571_New_South_Wales_20200402_null_1,epi_isl_449214_Scotland_20200428_null_1,epi_isl_451340_Sichuan_20200206_null_2,(epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1,epi_isl_451389_Sichuan_20200130_null_4)Node1158,epi_isl_421893_England_20200327_null_1,(epi_isl_444198_England_20200415_null_1,epi_isl_449726_England_20200417_null_3)Node1153,epi_isl_447887_California_20200327_null_3,epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1,epi_isl_447757_Tolima_20200331_null_10,(epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2)Node1145,(epi_isl_449695_England_20200415_null_4,epi_isl_451849_Jura_20200331_null_1)Node1142,(epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1,epi_isl_423825_England_20200322_null_1)Node720,(epi_isl_423494_England_20200331_null_1,epi_isl_451193_Uganda_20200330_null_8)Node717,(epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1,epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3)Node714,(epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_1)Node711,epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1,epi_isl_449257_Scotland_20200428_null_2,epi_isl_451188_Uganda_20200330_null_2,epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2,((epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4,epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1)Node505,epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1)Node504,(epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1,epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1,epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1,epi_isl_450076_New_York_20200319_null_5)Node484,(epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1,(epi_isl_450451_California_20200326_null_1,epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1,epi_isl_451706_Bern_20200316_null_78,epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1,epi_isl_440303_England_20200318_null_1)Node493,epi_isl_451631_New_South_Wales_20200326_null_13)Node491,epi_isl_433746_England_20200327_null_1,epi_isl_449220_Scotland_20200428_null_4,epi_isl_450412_Hong_Kong_20200130_null_9,epi_isl_449206_Scotland_20200427_null_2,epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1,epi_isl_447521_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2,epi_isl_451803_Basel_Stadt_20200330_null_4,epi_isl_420191_England_20200327_null_1,epi_isl_447357_Jerusalem_District_20200402_null_1,((epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1,epi_isl_448738_England_20200101_null_10,epi_isl_451909_Aargau_20200407_null_1)Node683,epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1)Node682,((epi_isl_444065_California_20200430_null_1,epi_isl_451511_New_South_Wales_20200329_null_4)Node678,epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1)Node677,(epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_444173_England_20200411_null_15)Node669,(epi_isl_429037_California_20200325_null_1,epi_isl_445174_California_20200331_null_1)Node666,(epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1,epi_isl_444125_England_20200408_null_1,epi_isl_447722_France_20200301_null_6)Node661,(epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1,epi_isl_449131_England_20200408_null_4)Node658,(epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1,epi_isl_425436_England_20200401_null_1,epi_isl_423803_England_20200324_null_6,epi_isl_423804_England_20200324_null_1)Node651,epi_isl_448924_Northern_Ireland_20200326_null_11,epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3,(epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1,epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3,epi_isl_438597_England_20200421_null_1)Node646,(epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1,epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_7)Node643,(epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1,epi_isl_449639_England_20200404_null_50)Node640,epi_isl_451759_Aargau_20200326_null_3,(epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1,epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3)Node636,(epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6,epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2)Node633,(epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1,epi_isl_450457_California_20200323_null_1)Node630,(epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1,epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2)Node627,(epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2,epi_isl_432600_England_20200329_null_1)Node624,(epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1,epi_isl_449635_England_20200404_null_2)Node621,epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1,epi_isl_418309_England_20200325_null_1,epi_isl_436940_LA_20200408_null_2,(epi_isl_424181_USA_20200316_null_1,epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5)Node618,(epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1,epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1)Node615,(epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5,epi_isl_441037_England_20200404_null_2)Node612,(epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8,epi_isl_449867_Washington_20200408_null_2)Node609,((epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1,epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1)Node579,(epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10,epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1)Node576,epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1,epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1,epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1,epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1,epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1,epi_isl_447593_New_Taipei_City_20200401_null_1,epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1,epi_isl_444054_California_20200429_null_1,epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2,epi_isl_451611_New_South_Wales_20200324_null_1273,epi_isl_444069_California_20200430_null_1,epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1,epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1,epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1,epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1,epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1,epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1,epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1,epi_isl_449959_Washington_20200415_null_5)Node535,(epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1,epi_isl_447390_North_District_20200329_null_1,epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1,epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1,epi_isl_451895_Basel_Stadt_20200407_null_576,epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1,epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1,epi_isl_451153_Gujarat_20200510_null_1,epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1,epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_2,epi_isl_447046_Gujarat_20200504_null_1,epi_isl_447341_Jerusalem_District_20200415_null_1,epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1)Node582,epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1,epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1,epi_isl_448875_England_20200414_null_15,epi_isl_423055_England_20200319_null_1,epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1,epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1,epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2,epi_isl_449117_England_20200408_null_17,epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1,epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_451987_Malopolska_20200401_null_5,epi_isl_450464_California_20200407_null_1,epi_isl_448845_England_20200416_null_3,epi_isl_450816_Skane_20200422_null_10,epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1,epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1,epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2,epi_isl_451502_New_South_Wales_20200326_null_3,epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1,epi_isl_448555_England_20200407_null_11,(epi_isl_448932_Northern_Ireland_20200326_null_2,epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2)Node246,epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2,(epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3,epi_isl_444265_England_20200418_null_5)Node241,epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2,(epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1)Node236,epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1,epi_isl_429644_Washington_20200408_null_4,epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1,epi_isl_444282_England_20200416_null_1,(epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1,epi_isl_450716_Wisconsin_20200417_null_1)Node226,epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1,(epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_450023_New_York_20200318_null_7)Node673,epi_isl_448802_England_20200407_null_5,(epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1)Node221,epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1,(epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1,epi_isl_448380_England_20200502_null_14)Node690,(epi_isl_420730_England_20200327_null_1,epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4,epi_isl_448692_England_20200101_null_1)Node695,epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1,epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1,epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1,epi_isl_435637_California_20200311_null_1,epi_isl_442392_England_20200408_null_2,epi_isl_449478_Wuhan_20200122_null_2,(epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1,epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4)Node701,(epi_isl_449907_Washington_20200413_null_5,epi_isl_449966_Washington_20200415_null_3)Node707,epi_isl_447524_Comunitat_Valenciana_20200401_null_5,epi_isl_451420_New_York_20200321_null_8,epi_isl_442700_England_20200406_null_1,epi_isl_448339_England_20200423_null_4,epi_isl_451357_Sichuan_20200203_null_11,epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3,epi_isl_448490_England_20200405_null_6,epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1,epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1,((epi_isl_444342_England_20200427_null_1,epi_isl_437571_California_20200425_null_2,epi_isl_451748_Valais_20200325_null_1)Node1039,epi_isl_433715_England_20200404_null_1)Node1038,(epi_isl_433677_England_20200402_null_1,epi_isl_433679_England_20200402_null_1)Node1035,(epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1,epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2,epi_isl_444451_England_20200415_null_1,epi_isl_447152_Li_ge_20200418_null_9)Node1026,epi_isl_450745_Ho_Chi_Minh_City_20200326_null_4,(epi_isl_438717_England_20200425_null_1,epi_isl_448054_England_20200502_null_21)Node1019,(epi_isl_448052_England_20200504_null_7,epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_34)Node1022,(epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1,epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6)Node1046,(epi_isl_444328_England_20200427_null_1,epi_isl_448114_England_20200506_null_7)Node1049,epi_isl_451265_Louisiana_20200506_null_3,((epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_447173_Michigan_20200319_null_1,epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_206,epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1,epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1,epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1)Node1098,epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1)Node1097,((epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_423579_England_20200331_null_1)Node1084,(epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1,epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1)Node1087)Node1083,((epi_isl_417939_California_20200318_null_1,epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1)Node1079,epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1)Node1078,(epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3,epi_isl_445182_California_20200412_null_1,epi_isl_448664_England_20200101_null_1)Node1073,((epi_isl_451089_South_Australia_20200326_null_1,epi_isl_451090_South_Australia_20200326_null_1)Node1070,epi_isl_423124_England_20200324_null_1,epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1)Node1066,(epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1,epi_isl_448721_England_20200101_null_3)Node1060,(epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1,epi_isl_451636_New_South_Wales_20200310_null_18)Node1063,(epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1,epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_3)Node1091,(epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1,epi_isl_450754_Minnesota_20200330_null_4)Node1094,epi_isl_449148_England_20200418_null_2,((epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1,epi_isl_440995_England_20200402_null_3)Node1129,epi_isl_418737_England_20200317_null_1)Node1128,(epi_isl_451465_New_York_20200321_null_8,epi_isl_451554_New_South_Wales_20200402_null_11)Node1125,(epi_isl_447402_North_District_20200402_null_1,epi_isl_451610_New_South_Wales_20200402_null_234,epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1,epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1)Node1115,(epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1,epi_isl_450786_Gujarat_20200510_null_11)Node1122,epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_445298_Rancagua_20200323_null_1,epi_isl_448383_England_20200502_null_4,(epi_isl_423778_England_20200324_null_1,epi_isl_448221_Scotland_20200423_null_2)Node1007,epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1,(epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_442736_England_20200405_null_3)Node1001,epi_isl_423467_England_20200330_null_1,epi_isl_451369_Sichuan_20200208_null_2,epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1,epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_451915_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_451888_Vaud_20200406_null_1,epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1,epi_isl_451886_Bern_20200406_null_1,epi_isl_451885_Basel_Stadt_20200406_null_1,epi_isl_451883_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_451879_Bern_20200407_null_1,epi_isl_451875_Glarus_20200407_null_1,epi_isl_451863_Zurich_20200407_null_1,epi_isl_450272_Saint_Petersburg_20200421_null_1,epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2,epi_isl_448049_England_20200506_null_3,epi_isl_451860_Valais_20200407_null_1,epi_isl_451859_Basel_Land_20200407_null_4,epi_isl_451852_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1,epi_isl_451810_Basel_Land_20200331_null_1,epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_1,epi_isl_451791_Graubunden_20200325_null_1,epi_isl_451785_Basel_Land_20200325_null_1,epi_isl_451764_Basel_Land_20200326_null_1,epi_isl_451714_Vaud_20200316_null_1,epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1,epi_isl_425425_England_20200330_null_1,epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1,epi_isl_451707_Schwyz_20200316_null_1,epi_isl_449832_Utah_20200409_null_1,epi_isl_449011_England_20200420_null_1,epi_isl_448466_England_20200406_null_1,epi_isl_448297_England_20200414_null_1,epi_isl_447214_Michigan_20200318_null_1,epi_isl_445553_Wales_20200406_null_1,epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1,epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1,epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1,(epi_isl_447306_South_Coast_District_20200322_null_4,epi_isl_448150_Scotland_20200411_null_1)Node174,epi_isl_445629_Wales_20200407_null_1,(epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1,epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2,epi_isl_444057_California_20200428_null_5)Node179,epi_isl_423399_England_20200329_null_2,epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1,epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2,epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1,epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1,epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4,epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1,epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_449673_England_20200415_null_1,epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1,epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2,epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1,epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1,epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1,epi_isl_423783_England_20200324_null_1,epi_isl_423569_England_20200331_null_1,epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1,epi_isl_423567_England_20200401_null_1,epi_isl_423492_England_20200331_null_1,epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2,epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1,epi_isl_437557_California_20200330_null_1,epi_isl_423454_England_20200331_null_1,epi_isl_423387_England_20200328_null_2,epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1,epi_isl_423153_England_20200324_null_1,epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_451697_Bern_20200316_null_1,epi_isl_449025_England_20200420_null_1,epi_isl_451228_Louisiana_20200429_null_2,epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1,epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2,((epi_isl_420287_England_20200320_null_2,epi_isl_423363_England_20200329_null_1)Node794,epi_isl_445573_Wales_20200406_null_1)Node793,epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3,epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1,epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1,epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2,epi_isl_445338_Temuco_20200325_null_1,epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1,epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1,((epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1,epi_isl_448777_England_20200408_null_1)Node805,epi_isl_448799_England_20200408_null_3)Node804,epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_1,epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1,(epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1,epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1)Node147,epi_isl_432733_England_20200401_null_1,epi_isl_440403_England_20200314_null_1,epi_isl_451776_Basel_Land_20200326_null_3,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,(epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_1,epi_isl_450309_Quebec_20200327_null_10,epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1)Node818,(epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1)Node823,epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2,epi_isl_449728_England_20200417_null_8,epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1,epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1,epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1,epi_isl_448344_England_20200423_null_2,(epi_isl_445873_Wales_20200408_null_1,epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6,epi_isl_447573_Telangana_20200401_null_1)Node841,(epi_isl_451713_Basel_Stadt_20200316_null_1,epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2,epi_isl_447848_Telangana_20200401_null_1)Node846,epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2,epi_isl_448666_England_20200101_null_1,epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1,epi_isl_451752_Vaud_20200325_null_1,epi_isl_436658_California_20200409_null_1,epi_isl_451914_Vaud_20200407_null_12,epi_isl_448318_England_20200422_null_1,(epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1,epi_isl_449063_England_20200504_null_1)Node860,(epi_isl_447119_Temuco_20200326_null_1,epi_isl_451397_Sichuan_20200131_null_12)Node863,epi_isl_420718_England_20200327_null_1,((epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1,epi_isl_423457_England_20200328_null_2,epi_isl_423461_England_20200330_null_1)Node871,epi_isl_423178_England_20200324_null_2)Node870,epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1,((epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1,epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2)Node883,epi_isl_451870_Graubunden_20200407_null_1)Node882,epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4,((epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1,epi_isl_448171_Scotland_20200412_null_1)Node891,epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1)Node890,epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1,epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11,epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1,epi_isl_451911_Zurich_20200407_null_1,epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1,(epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1,epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1)Node131,epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1,(epi_isl_451312_Sichuan_20200126_null_1,epi_isl_451315_Sichuan_20200130_null_4)Node936,(epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4)Node930,(epi_isl_448336_England_20200423_null_1,epi_isl_448488_England_20200407_null_5,epi_isl_449171_England_20200418_null_2)Node925,epi_isl_449014_England_20200420_null_4,((epi_isl_444348_England_20200426_null_1,epi_isl_447153_Li_ge_20200418_null_1)Node918,epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3,epi_isl_451161_Gujarat_20200503_null_119,epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1,epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1,epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1)Node906,(epi_isl_447575_Telangana_20200402_null_1,epi_isl_447579_Telangana_20200410_null_1)Node921,epi_isl_448430_England_20200429_null_2,epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1,epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1,epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2,epi_isl_448332_England_20200423_null_1,epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3,epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1,epi_isl_448443_England_20200422_null_4,epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1,epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1,epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4,epi_isl_447412_Jerusalem_District_20200317_null_1,epi_isl_448477_England_20200405_null_7,epi_isl_441296_England_20200401_null_1,epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1,((epi_isl_423158_England_20200324_null_2,epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1)Node110,epi_isl_451155_Gujarat_20200503_null_7)Node109,epi_isl_423530_England_20200325_null_1,epi_isl_448881_England_20200417_null_48,epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1,epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1)Node1,epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1,epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_5)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1":"test",
"Node1001":"test",
"Node1007":"test",
"Node1019":"test",
"Node1022":"test",
"Node1026":"test",
"Node1035":"test",
"Node1038":"test",
"Node1039":"test",
"Node1046":"test",
"Node1049":"test",
"Node1060":"test",
"Node1063":"test",
"Node1066":"test",
"Node1070":"test",
"Node1073":"test",
"Node1078":"test",
"Node1079":"test",
"Node1083":"test",
"Node1084":"test",
"Node1087":"test",
"Node109":"test",
"Node1091":"test",
"Node1094":"test",
"Node1097":"test",
"Node1098":"test",
"Node110":"test",
"Node1115":"test",
"Node1122":"test",
"Node1125":"test",
"Node1128":"test",
"Node1129":"test",
"Node1142":"test",
"Node1145":"test",
"Node1153":"test",
"Node1158":"test",
"Node1161":"test",
"Node1164":"test",
"Node1170":"test",
"Node1182":"test",
"Node1188":"test",
"Node1189":"test",
"Node1197":"test",
"Node131":"test",
"Node147":"test",
"Node174":"test",
"Node179":"test",
"Node221":"test",
"Node226":"test",
"Node236":"test",
"Node241":"test",
"Node246":"test",
"Node422":"test",
"Node434":"test",
"Node438":"test",
"Node462":"test",
"Node484":"test",
"Node491":"test",
"Node493":"test",
"Node504":"test",
"Node505":"test",
"Node535":"test",
"Node576":"test",
"Node579":"test",
"Node582":"test",
"Node609":"test",
"Node612":"test",
"Node615":"test",
"Node618":"test",
"Node621":"test",
"Node624":"test",
"Node627":"test",
"Node630":"test",
"Node633":"test",
"Node636":"test",
"Node640":"test",
"Node643":"test",
"Node646":"test",
"Node651":"test",
"Node658":"test",
"Node661":"test",
"Node666":"test",
"Node669":"test",
"Node673":"test",
"Node677":"test",
"Node678":"test",
"Node682":"test",
"Node683":"test",
"Node690":"test",
"Node695":"test",
"Node701":"test",
"Node707":"test",
"Node711":"test",
"Node714":"test",
"Node717":"test",
"Node720":"test",
"Node793":"test",
"Node794":"test",
"Node804":"test",
"Node805":"test",
"Node818":"test",
"Node823":"test",
"Node841":"test",
"Node846":"test",
"Node860":"test",
"Node863":"test",
"Node870":"test",
"Node871":"test",
"Node882":"test",
"Node883":"test",
"Node890":"test",
"Node891":"test",
"Node906":"test",
"Node918":"test",
"Node921":"test",
"Node925":"test",
"Node930":"test",
"Node936":"test",
"epi_isl_406844_Victoria_20200125_null_1":"background",
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_408484_Sichuan_20200115_null_1":"background",
"epi_isl_411956_Texas_20200211_null_1":"background",
"epi_isl_413596_NSW_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_415503_Noord_Brabant_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_415594_Washington_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416374_Shanghai_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_416395_Shanghai_20200209_null_1":"background",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_416495_Hauts_de_France_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_416702_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_416746_ARA_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_416994_Castilla_y_Le_n_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_417365_Washington_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_417374_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_417420_NanChang_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_417520_Taoyuan_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_417689_Reykjavik_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_417709_Reykjavik_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_417972_Madrid_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_418065_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418078_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418080_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418309_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_418330_Ontario_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_418341_Ontario_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_418390_Finland_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418737_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418835_British_Columbia_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_418850_British_Columbia_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418928_Washington_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418977_New_York_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419405_Wales_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_419675_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_419819_Victoria_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419952_Victoria_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_419987_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_419994_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_420191_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420287_England_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420357_Etterbeek_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420718_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420730_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421189_Li_ge_20200330_null_3":"background",
"epi_isl_421305_Wisconsin_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421489_Portugal_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_421514_Centre__Val_de_Loire_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_421616_New_York_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_421631_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421688_Minnesota_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_421707_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421728_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421743_Luxembourg_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422255_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_422332_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_422505_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_422713_Netherlands_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_422741_Netherlands_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_422775_Netherlands_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422860_Noord_Brabant_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_422925_Zuid_Holland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_422947_Zuid_Holland_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422954_Zuid_Holland_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_423008_Washington_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_423011_Washington_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_423027_Washington_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423124_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423136_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423153_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423158_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_423178_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423387_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423457_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_423461_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423467_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423494_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423530_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423778_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423803_England_20200324_null_6":"background",
"epi_isl_423804_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423808_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_424181_USA_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_424220_Washington_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_424277_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424286_Oregon_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424339_Washington_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_10":"background",
"epi_isl_424491_Reykjavik_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_424849_Arizona_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_424893_Virginia_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_424947_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425061_Ghent_20200325_null_9":"background",
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_425279_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_425425_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_425436_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425491_England_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_425658_Scotland_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_425699_Scotland_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_425724_Scotland_20200312_null_3":"background",
"epi_isl_425788_Scotland_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_425810_Scotland_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_425863_Scotland_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_426072_Idaho_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426325_New_York_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_426469_Virginia_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426530_Arizona_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_426668_Victoria_20200322_null_3":"background",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426754_Victoria_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_426817_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426833_Victoria_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_426878_Victoria_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427129_Victoria_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_427140_Victoria_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_427288_Ohio_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427349_Liege_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_427457_Wisconsin_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_427493_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_427610_New_York_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_427664_New_South_Wales_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_427710_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427721_New_South_Wales_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_427740_New_South_Wales_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_427765_New_South_Wales_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_428231_New_Taipei_City_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_428260_Wisconsin_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_428752_Connecticut_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_428761_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_428767_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428794_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428850_Singapore_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_428861_Moscow_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_428866_Lipetsk_Region_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_428904_Moscow_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429037_California_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429182_Bangkok_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429229_Abruzzo_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_429294_Unknown_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_429336_Unknown_20200303_null_11":"background",
"epi_isl_429452_Unknown_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_429463_Unknown_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_429565_Unknown_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429612_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_429782_Luxembourg_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_429789_Luxembourg_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_430008_Amman_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_430070_St_Petersburg_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430109_St_Petersburg_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_430124_Washington_20200306_null_5":"background",
"epi_isl_430148_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_430191_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_430326_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430341_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430414_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430439_Malaysia_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430514_Victoria_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_430525_Victoria_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430537_Victoria_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430547_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_430652_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430653_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430706_Victoria_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_430731_Beijing_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_430819_Egypt_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_430934_Washington_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_431013_Alaska_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_4":"background",
"epi_isl_431986_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432009_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432040_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432077_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432236_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432336_Wales_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_432442_Wales_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_432733_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432896_Scotland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_433161_Scotland_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_433180_Scotland_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433507_Scotland_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433677_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433679_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433715_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433746_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_433793_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_433858_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434127_Washington_20200308_null_2":"background",
"epi_isl_434244_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434315_Washington_20200330_null_6":"background",
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_434354_Ghent_20200327_null_4":"background",
"epi_isl_434461_Athens_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_434462_Athens_20200323_null_4":"background",
"epi_isl_434531_Louisiana_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_434539_Costa_Rica_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434541_Puerto_Rico_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_434606_Virginia_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_434630_Occitanie_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_5":"background",
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_2":"background",
"epi_isl_434697_Nonthaburi_20200303_null_2":"background",
"epi_isl_434833_Texas_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_435022_Texas_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_435023_Texas_20200403_null_5":"background",
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_435047_Nur_Sultan_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435077_Maharashtra_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435100_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435103_Ladakh_20200317_null_3":"background",
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435109_Delhi_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435110_Delhi_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_435127_United_Arab_Emirates_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435133_United_Arab_Emirates_20200310_null_4":"background",
"epi_isl_435429_Szeged_20200328_null_3":"background",
"epi_isl_435471_Louisiana_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_435475_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435537_New_York_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_435543_New_York_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_435637_California_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435698_Singapore_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_436046_Virginia_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_436076_New_York_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_436081_New_York_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_436123_Victoria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436157_Karnataka_20200417_null_3":"background",
"epi_isl_436254_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436373_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_436374_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_436392_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_436444_Maharashtra_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436462_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_436620_Wisconsin_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_436630_Wisconsin_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_436658_California_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_436732_Abruzzo_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_436871_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436940_LA_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_437140_Michigan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_437319_Kocaeli_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437340_Kinshasa_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_437514_Alaska_20200323_null_8":"background",
"epi_isl_437526_Oregon_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437528_Oregon_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_437531_Oregon_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_437557_California_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_437571_California_20200425_null_2":"background",
"epi_isl_437597_California_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_437626_Telengana_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437747_Madinah_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437793_Virginia_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_437857_Washington_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_437874_Athens_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_437930_Ischgl_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_437939_Strass_im_Zillertal_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437967_St__Anton_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_438052_Vienna_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_438062_Vienna_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_438597_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_438625_England_20200421_null_5":"background",
"epi_isl_438717_England_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_438883_Scotland_20200318_null_4":"background",
"epi_isl_438906_Scotland_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_439085_Scotland_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439224_Scotland_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_439301_Scotland_20200427_null_7":"background",
"epi_isl_439709_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_439807_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_440303_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_440403_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440995_England_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_440999_England_20200402_null_4":"background",
"epi_isl_441037_England_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_441296_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_441432_Northern_Ireland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_441884_England_20200430_null_2":"background",
"epi_isl_441927_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442005_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442155_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442392_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_442516_England_20200408_null_12":"background",
"epi_isl_442641_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442700_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442736_England_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_443230_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443232_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443236_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443261_Bourgogne_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_444054_California_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_444057_California_20200428_null_5":"background",
"epi_isl_444065_California_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444069_California_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444151_England_20200409_null_11":"background",
"epi_isl_444173_England_20200411_null_15":"background",
"epi_isl_444184_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_444198_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444220_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444242_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_444265_England_20200418_null_5":"background",
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_444328_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444348_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_444451_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444709_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_444712_New_York_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_444720_New_York_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_444730_New_York_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_444744_New_Jersey_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_444793_Queensland_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_444850_Unknown_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444855_Unknown_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_444942_Unknown_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_444978_Catalonia_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_445144_Louisiana_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_445182_California_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_445288_Punta_Arenas_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_445298_Rancagua_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_445338_Temuco_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_445373_Santiago_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_445553_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445573_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445629_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_445873_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_445946_Wales_20200401_null_17":"background",
"epi_isl_447046_Gujarat_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_447064_Michigan_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_447119_Temuco_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_447133_Li_ge_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_447152_Li_ge_20200418_null_9":"background",
"epi_isl_447153_Li_ge_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_447173_Michigan_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_447214_Michigan_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_447303_South_Coast_District_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_447306_South_Coast_District_20200322_null_4":"background",
"epi_isl_447314_Tel_Aviv_District_20200405_null_4":"background",
"epi_isl_447341_Jerusalem_District_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_447357_Jerusalem_District_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_447390_North_District_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447402_North_District_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_447404_North_District_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447412_Jerusalem_District_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447521_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_447524_Comunitat_Valenciana_20200401_null_5":"background",
"epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_2":"background",
"epi_isl_447573_Telangana_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447575_Telangana_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_447579_Telangana_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_447591_Taipei_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_447593_New_Taipei_City_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447722_France_20200301_null_6":"background",
"epi_isl_447757_Tolima_20200331_null_10":"background",
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_7":"background",
"epi_isl_447815_Cundinamarca_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_447848_Telangana_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447887_California_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1":"background",
"epi_isl_448049_England_20200506_null_3":"background",
"epi_isl_448052_England_20200504_null_7":"background",
"epi_isl_448054_England_20200502_null_21":"background",
"epi_isl_448114_England_20200506_null_7":"background",
"epi_isl_448150_Scotland_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_448171_Scotland_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_448221_Scotland_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_448297_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_448318_England_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_448332_England_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_448336_England_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_448339_England_20200423_null_4":"background",
"epi_isl_448344_England_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_448380_England_20200502_null_14":"background",
"epi_isl_448383_England_20200502_null_4":"background",
"epi_isl_448430_England_20200429_null_2":"background",
"epi_isl_448443_England_20200422_null_4":"background",
"epi_isl_448466_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_448477_England_20200405_null_7":"background",
"epi_isl_448488_England_20200407_null_5":"background",
"epi_isl_448490_England_20200405_null_6":"background",
"epi_isl_448555_England_20200407_null_11":"background",
"epi_isl_448664_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448666_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448692_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448721_England_20200101_null_3":"background",
"epi_isl_448735_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448738_England_20200101_null_10":"background",
"epi_isl_448761_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448772_England_20200101_null_20":"background",
"epi_isl_448777_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_448785_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_448790_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_448799_England_20200408_null_3":"background",
"epi_isl_448802_England_20200407_null_5":"background",
"epi_isl_448845_England_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_448875_England_20200414_null_15":"background",
"epi_isl_448881_England_20200417_null_48":"background",
"epi_isl_448924_Northern_Ireland_20200326_null_11":"background",
"epi_isl_448932_Northern_Ireland_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_449011_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_449014_England_20200420_null_4":"background",
"epi_isl_449025_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_449063_England_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_449117_England_20200408_null_17":"background",
"epi_isl_449131_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_449143_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_449148_England_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_449171_England_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_449206_Scotland_20200427_null_2":"background",
"epi_isl_449214_Scotland_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_449217_Scotland_20200428_null_3":"background",
"epi_isl_449220_Scotland_20200428_null_4":"background",
"epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_5":"background",
"epi_isl_449257_Scotland_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_449300_Scotland_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_449478_Wuhan_20200122_null_2":"background",
"epi_isl_449632_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_449635_England_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_449639_England_20200404_null_50":"background",
"epi_isl_449673_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_449695_England_20200415_null_4":"background",
"epi_isl_449726_England_20200417_null_3":"background",
"epi_isl_449728_England_20200417_null_8":"background",
"epi_isl_449832_Utah_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_449867_Washington_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_449907_Washington_20200413_null_5":"background",
"epi_isl_449959_Washington_20200415_null_5":"background",
"epi_isl_449966_Washington_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_450023_New_York_20200318_null_7":"background",
"epi_isl_450076_New_York_20200319_null_5":"background",
"epi_isl_450119_New_York_20200308_null_3":"background",
"epi_isl_450268_Saint_Petersburg_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_450272_Saint_Petersburg_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_450308_Quebec_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_450309_Quebec_20200327_null_10":"background",
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_34":"background",
"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_1":"background",
"epi_isl_450412_Hong_Kong_20200130_null_9":"background",
"epi_isl_450451_California_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_450457_California_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_450464_California_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_450524_Latvia_20200419_null_2":"background",
"epi_isl_450716_Wisconsin_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_450745_Ho_Chi_Minh_City_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_450754_Minnesota_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_450786_Gujarat_20200510_null_11":"background",
"epi_isl_450816_Skane_20200422_null_10":"background",
"epi_isl_451089_South_Australia_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451090_South_Australia_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451153_Gujarat_20200510_null_1":"background",
"epi_isl_451155_Gujarat_20200503_null_7":"background",
"epi_isl_451161_Gujarat_20200503_null_119":"background",
"epi_isl_451188_Uganda_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_451193_Uganda_20200330_null_8":"background",
"epi_isl_451228_Louisiana_20200429_null_2":"background",
"epi_isl_451265_Louisiana_20200506_null_3":"background",
"epi_isl_451273_Louisiana_20200508_null_13":"background",
"epi_isl_451312_Sichuan_20200126_null_1":"background",
"epi_isl_451315_Sichuan_20200130_null_4":"background",
"epi_isl_451340_Sichuan_20200206_null_2":"background",
"epi_isl_451357_Sichuan_20200203_null_11":"background",
"epi_isl_451369_Sichuan_20200208_null_2":"background",
"epi_isl_451389_Sichuan_20200130_null_4":"background",
"epi_isl_451397_Sichuan_20200131_null_12":"background",
"epi_isl_451420_New_York_20200321_null_8":"background",
"epi_isl_451438_New_York_20200326_null_6":"background",
"epi_isl_451465_New_York_20200321_null_8":"background",
"epi_isl_451486_New_South_Wales_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_451502_New_South_Wales_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_451511_New_South_Wales_20200329_null_4":"background",
"epi_isl_451554_New_South_Wales_20200402_null_11":"background",
"epi_isl_451571_New_South_Wales_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_451610_New_South_Wales_20200402_null_234":"background",
"epi_isl_451611_New_South_Wales_20200324_null_1273":"background",
"epi_isl_451631_New_South_Wales_20200326_null_13":"background",
"epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_206":"background",
"epi_isl_451636_New_South_Wales_20200310_null_18":"background",
"epi_isl_451644_Pomorze_20200502_null_1":"background",
"epi_isl_451697_Bern_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451706_Bern_20200316_null_78":"background",
"epi_isl_451707_Schwyz_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451713_Basel_Stadt_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451714_Vaud_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451741_Basel_Land_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451748_Valais_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451752_Vaud_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451759_Aargau_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451764_Basel_Land_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451776_Basel_Land_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_451785_Basel_Land_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451791_Graubunden_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451803_Basel_Stadt_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_451810_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451849_Jura_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451852_Zurich_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451859_Basel_Land_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_451860_Valais_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451863_Zurich_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451870_Graubunden_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_451875_Glarus_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451879_Bern_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451883_Basel_Land_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451885_Basel_Stadt_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_451886_Bern_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_451888_Vaud_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_451895_Basel_Stadt_20200407_null_576":"background",
"epi_isl_451909_Aargau_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451911_Zurich_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451914_Vaud_20200407_null_12":"background",
"epi_isl_451915_Basel_Land_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451948_Belarus_20200301_null_10":"background",
"epi_isl_451976_Malopolska_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_451977_Malopolska_20200403_null_16559":"background",
"epi_isl_451987_Malopolska_20200401_null_5":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":26
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":13
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":40
}
}
}